两类藻毒素聚酮合成酶遗传相似性及其二级结构预测分析.pdfVIP

维普资讯 第 26卷第 4期 环 境 科 学 学 报 Vo1．26，No．4 2006年 4月 ActaScientiaeCircumstantiae Apr．，2006 司纪亮，吴学森．2006．两类藻毒素聚酮合成酶遗传相似性及其二级结构预测分析 [J]．环境科学学报 ，26(4)：640—645 SiJL．WuXS．2006．Geneticsimilarityandsecondarystructurepredictionoftwocyanobacterialtoxins’polyketidesynthetases[J]·ActaScientiae Circumstantiae，26(4)：640—645 两类藻毒素聚酮合成酶遗传相似性及其二级结构预 测分析 司纪亮 一 ，吴学森 1．山东大学环境科学与工程 学院，济南 250071 2．复旦大学生命科学院理论 系统生物 实验 室，上海 200433 收稿 日期 ：2005—07—26 修回 日期：2006—03—03 录 用 日期 ：2006—03—03 摘要：研究微囊藻毒素聚酮合成酶、节球藻毒素聚酮合成酶之间的遗传关联性，并对其二级结构进行预测分析．应用聚合酶链反应得到2株蓝 绿藻的毒素聚酮合成酶(PKS)基 因，并进行基因序列分析．从GenBank中提取产微囊藻毒素 、产节球藻毒素藻株的相应基 因序列 ，利用DNAStar 和phylip软件分析 目的基因一致性及2类藻毒素PKS的进化情况．采用 Gamier—Robson法 、Karplus—Schulz法预测项 圈藻株202A1／35、节球藻 株 NSOR10PKS蛋白片段 的二级结构 ，Kyte—doolittle法分析蛋 白的亲水性 ，Emini法预测蛋 白质 的表面可能性．结果表明，2类藻毒素PKS 目的基 因的相似性非常高 ；项圈藻属、念珠藻属的微囊藻毒素 PKS与节球藻毒素 PKS的进化关系较近；2种藻毒素 PKS分析片段二级结构具有较大 的相似性，其亲水性与表面可能性区域等特征也极为相似． 关键词 ：微囊藻毒素 ；节球藻毒素 ；聚酮合成酶；遗传相似性 ；二级结构预测 文章编号 ：0253-2468(2006)04·0640—06 中图分类号 ：X171．5 文献标 识码 ：A Genetic similarity and secondary structure prediction of two cyan0bacterial toxins’polyketidesynthetases SIJiliang。 W u Xuesen ， 1．SchoolofEnvironmentalScienceandEngineering，ShandongUniversity，Jinan250071 2．Laboratory ofTheoreticalSystem Biology，SchoolofLifeScience，FudanUniversity，Shanghai200433 Received26July2005； receivedinrevisedform 3March2006； accepted3March2006 Abstract：toinvestigatethegenetic similarityand secondary sturctureprediction ofpolyketidesynthetasescorrespondingtomicrocystinsandnodularins， respectively．Geneofpolyketidesynthase(PKS)from2toxin—producingcyanobacteriawaspreparedbypolymerasechainreactionandthegenesequence wasanalyzed．Thegene sequencesofPKS from m