基因组时代的分子系统发育分析.pdfVIP

上海交通大学——中科院昆明动物所 吴楚 基因组时代的分子系统发育分析 学生：上海交通大学 生命科学与技术学院 吴楚 指导教师：上海交通大学 农业与生物学院 王起山 关键字：锌指蛋白，调控网络，小鼠大脑，调控模式 1. 绪论 分子系统发育分析，顾名思义，其研究对象是DNA 或蛋白质的分子序列信息，包括DNA 、蛋 白质的突变、密码子用法等，通过统计方法、实用的数学模型和计算机程序的辅助，计算序列间的 相似性或同源性，估计进化速率、分歧时间、某物种或基因的系统发育位置、适应性进化事件或位 点等。 目前多种生物的全基因组测序已完成，越来越多的数据可以直接利用。首先，通过测序分析, 可 以确定基因成簇的模式与范围, 通过比较种属间亲缘关系, 来预测某一功能相似的基因在其他物种 中的位置。其次，比较基因组的另一作用在于可以区分同源区域与同源共生区域。这对本身就位于 同源共生区域的抗性基因家族可能困难, 但是抗性基因相关序列的种间比较结果显示: