氨氧化古菌研究进展.pdfVIP

华 南 理 工 大 学 学 报 （自然科 学版） 第４１ 卷 第１２期 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆＳｏｕｔｈ Ｃｈｉｎａ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｖｏｌ．４１　Ｎｏ．１２ ２０１３年１２月 （Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｅｄｉｔｉｏｎ） Ｄｅｃｅｍｂｅｒ　２０１３ 文章编号：１０００５６５Ｘ（２０１３）１２０１０７０８ 　 氨氧化古菌研究进展 罗剑飞　林炜铁 （华南理工大学 生物科学与工程学院，广东 广州５１０００６） ＋ － － 摘　要：硝化作用（ＮＨ ＮＯ ＮＯ ）是氮的生物地球化学循环的关键环节，氨氧化古４ ２ ３ 菌（ＡＯＡ）纯培养物和富集物的获得，以及古菌ａｍｏ基因在各种生态环境中的发现，说明 ＡＯＡ也是氨氧化作用的贡献者；特别是很多环境中ＡＯＡ ａｍｏ 的丰度是氨氧化细菌ＡＯＢ ａｍｏ 的数十倍甚至上万倍，而且ＡＯＡ具有比ＡＯＢ更高的氨氮亲和性，这些进一步说明了 氨氧化细菌（ＡＯＡ）可能是氨氧化作用的主要贡献者．文中综述了ＡＯＡ 菌株和富集物的 来源及基因组信息、基于系统发育的ＡＯＡ 分类、ＡＯＡ氨氧化作用在环境中的重要性，以 及ＡＯＡ反硝化作用的发现，并对今后的研究方向进行了展望． 关键词：氨氧化古菌；纯培养物；富集；氨氧化作用；反硝化作用；研究进展 中图分类号：Ｑ９３８；Ｘ１７２　　 ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１０００５６５Ｘ．２０１３．１２．０１８ ［９１５］ 　　百年来，作为生物硝化作用的限速步骤，由氨单 甚至数千倍，特别是在一些低溶氧的环境中 ． 加氧酶（ＡＭＯ）催化的氨氧化反应一直被认为是一些 ＡＯＡ 的发现极大地丰富了氮的生物地球化学 化能自养氨氧化细菌（ＡＯＢ）作用的结果；这些细菌主 循环的知识，自ＡＯＡ 和ＡＯＡ ａｍｏ 基因发现的不到 要包括来自 变形菌纲的Ｎｉｔｒｏｓｏｍｏｎａｓ 和Ｎｉｔｒｏｓｏｓｐｉｒａ β 十年间，国内外已做了大量的研究，国内也有多篇综 ［１］ ［１６１９］ 属的细菌和 变形菌纲Ｎｉｔｒｏｓｏｃｏｃｃｕｓ 属的细菌 ．然 γ 述报道 ．本课题组长期从事自然生态和人工生 而，通过对海洋和陆地环境中氨氧化作用的原位分 态中氮、硫、磷等元素的生物地球化学循环的理论研 析，发现很多氨氧化作用经常在较低的底物浓度下进 究，通过对珠三角地区淡水水产养殖环境中的氨氧 行，而这些底物浓度远远低于ＡＯＢ生长所需的浓度， 化微生物的研究，发现该环境中ＡＯＢ主要由 变形 β ［２］ 因此推测环境中还存在未知的氨氧化微生物 ． 菌纲的Ｎｉｔｏｓｏｍｏｎａｓ 和Ｎｉｔｒｏｓｏｓｐｉｒａ 组成，ＡＯＡ 主要 近年来，随着分子生物技术的发展，科学家们从 来自于 Ｃａｎｄｉｄａｔｕｓ Ｎｉｔｒｏｓｏｓｐｈａｅｒａ ｇａｒｇ