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近年蛋白质组学的研究进展.ppt
蛋白质组学的研究进展;蛋白质组学定义;蛋白质组学研究的策略;另一种策略称功能蛋白质组学即研究不同时期细胞蛋白质组成的变化, 如蛋白质在不同环境下的差异表达, 以发现有差异的蛋白质种类为主要目标。这种观点更倾向于把蛋白质组学作为研究生命现象的手段和方法。;蛋白质组研究范围;( 3) 对蛋白质的胞内分布及移位( 细胞图谱蛋白质组学)的研究: 确定蛋白质在亚细胞结构中的位置, 通过纯化细胞器或用质谱仪鉴定蛋白复合物组成等。
( 4)蛋白质的功能模式(功能蛋白质组学) : 目前主要集中在蛋白质与蛋白质及其与其他分子的相互作用网络关系的研究。 对蛋白质组组成的分析鉴定是蛋白质组学中的与基因组学相对应的主要内容。 它要求对蛋白质组进行表征, 即所有蛋白质的分离与鉴定及其图谱化。;蛋白质组学的技术;蛋白质组研究中的样品制备;蛋白质组研究中的样品分离和分析;二维色谱技术:
蛋白质混合物直接通过液相色谱分离, 然后进入 质谱系统获得肽段分子量; 再通过串联 质谱技术得到部分序列信息, 最终通过计算机联网查询, 就可以对蛋白进行鉴定。;质谱技术:
当前蛋白质组研究的核心技术就是双向凝胶电泳—— 质谱技术, 即通过双向凝胶电泳将蛋白质分离, 然后利用质谱对蛋白质逐一进行鉴定。;定量蛋白质组学;抗体芯片技术;蛋白质芯片上的探针蛋白可根据研究的目的不同, 选用抗体、 抗原、 受体、酶等具有生物活性、 高度特异性和亲和性的蛋白质。 与DNA 芯片一样, 蛋白质芯片同样蕴涵着丰富的信息量, 必须利用专门的计算机软件包进行图象分析、 结果定量和解释。 它能够同时分析上千种蛋白质的变化情况, 可用于疾病诊断、 蛋白质相互作用等研究, 是蛋白质组学研究比较有发展潜力的技术工具。
;酵母双杂交系统;基于酵母双杂交技术平台的特点, 它已经被应用在许多研究工作当中:
( 1)利用酵母双杂交发现新的蛋白质和蛋白质的新功能。
( 2)利用酵母双杂交在细胞体内研究抗原和抗体的相互作用。
( 3)利用酵母双杂交筛选药物的作用位点以及药物对蛋白质之间相互作用的影响。
( 4 )利用酵母双杂交建立基因组蛋白连锁图( GenomeProtein Linkage Map)。
;磷酸化蛋白质组学;生物传感芯片质谱技术;将两者有机结合起来便形成了生物传感芯片质谱。 它的核心是一块小的生物传感芯片, 由金黄色的玻璃底物构成, 此芯片在 BIA 和 MALDI- TOF- MS 中均可发挥作用。在 BIA中、 所需分析的可溶性蛋白质各自与结合在芯片表面的固定生物分子(受体)相互作用。 滞留在芯片上的蛋白质通过与基质结合而从与受体分子的相互作用中解离出来, 便可直接进行 MALDI- TOF- MS。 该法可用于筛选功能性蛋白质, 并可在蛋白质水平筛选基因的多态性, 从而能有效地将基因与蛋白质结合在一起。;蛋白质组生物信息学;噬菌体展示技术;噬菌体展示技术的原理 :
噬菌体展示技术是将多肽或蛋白质的编码基因或目的基因片段克隆入噬菌体外壳蛋白结构基因的适当位置,在阅读框正确且不影响其他外壳蛋白正常功能的情况下,使外源多肽或蛋白与外壳蛋白融合表达,融合蛋白随子代噬菌体的重新组装而展示在噬菌体表面。被展示的多肽或蛋白可以保持相对独立的空间结构和生物活性,以利于靶分子的识别和结合。;;蛋白质组学的发展趋势;在应用研究方面, 蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。 在对癌症、 早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面, 蛋白质组技术也有十分诱人的前景, 目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。;在技术发展方面, 蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存, 各有优势和局限的特点, 而难以像基因组研究一样形成比较一致的方法。 除了发展新方法外, 更强调各种方法间的整合和互补, 以适应不同蛋白质的不同特征。 另外,蛋白质组学与其他学科的交叉也将日益显著和重要, 这种交叉是新技术新方法的活水之源, 特别是蛋白质组学与其他大规模科学如基因组学、 生物信息学等领域的交叉, 所呈现出的系统生物学( System Biology)研究模式, 将成为未来生命科学最令人激动的新前沿。
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