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连接环、末端碱基及一价阳离子对G-四链体结构的影响.pdf
Vol.35 高等 学校 化 学 学报 No.12
2014年12月 CHEMICALJOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES 2556~2562
doi:10.7503/ cjc
连接环、末端碱基及一价阳离子对
G-四链体结构的影响
1 1 1 1 1 2 2
常天俊 ,李 刚 ,赵可旭 ,班 琳 ,卞文秀 ,邴 涛 ,上官棣华
(1. 河南理工大学资源环境学院,焦作454000;
2. 中国科学院化学研究所,北京分子科学国家实验室,活体分析化学院重点实验室,北京100190)
+
摘要 研究了G-四链体中的连接环(Loop)、末端碱基和一价阳离子对其结构的影响,发现在K 溶液中Loop
短的序列易形成平行结构,无末端碱基时容易形成多聚体,而反平行或混合平行/ 反平行的G-四链体则难以
+ + +
形成多聚体;一价阳离子K ,NH 和Na 促进形成平行结构及多聚体的能力依次减弱. 在平行 G-四链体的
4
3＇或5＇端增加非G碱基,或改变阳离子使其形成非平行结构,均可抑制多聚体的形成. Loop长度影响G-四
链体的热稳定性,Loop短的序列可形成很稳定的分子内结构;无末端碱基的G-四链体多聚体的稳定性低于
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单个G-四链体,且多聚体随着温度升高而变小. 结果表明,在K 溶液中,无末端碱基的平行G-四链体序列
首先形成分子内结构,然后通过π-π堆积形成多聚体;末端碱基及反平行或混合平行/ 反平行G-四链体中的
Loop可阻碍末端堆积作用,抑制多聚体的形成. 本研究为G-四链体的结构与功能研究提供了有用信息.
关键词 G-四链体;拓扑结构;DNA; 自组装;多聚体
中图分类号 O629.74 文献标志码 A
G-四链体(G-quadruplex)是由富含串联重复鸟嘌呤(G)的DNA 或 RNA 折叠形成的特殊结构.
G-四分体(G-quartet)是G-四链体的基本单元,是由4个碱基G之间通过Hoogsteen氢键形成的平面结
[1]
构[图1(A)],四分体间通过纵向疏水的π-π堆积形成四链体螺旋结构 . 可形成G-四链体的序列在
[2]
基因组中分布广泛,如人端粒、原癌基因启动子区以及RNA 的5＇-非翻译区 . 这些G-四链体序列涉
[3,4] [5]
及多种生理和病理过程,已成为药物设计的靶标 . 有些化学合成的G-四链体具有细胞识别 、抗
[6] [7] [8]
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