_反向免疫学_与免疫功能基因的发现.pdfVIP

生物化学与生物物理进展 ,2006,33(6):505~510 ProgressinBiochemistryandBiophysics 综述与专论 反向免疫学 与免疫功能基因的发现 “ ” 冯 晨 张 建 田志刚* (山东大学药学院，免疫药理与免疫治疗学研究所，济南 250012) 摘要 人类基因组测序的结束为生命科学领域展开了全新的一章.尽管已经得到了人类基因组的序列，但是隐藏在DNA序列 中的功能基因，它们之间的相互作用以及对整个机体的意义大部分有待发掘.近些年来形成的“反向生物学”为免疫功能基 因的发现、功能的研究及其应用价值提供了一套全新的技术与思路. 关键词 反向免疫学，功能基因，蛋白质功能检测 学科分类号 Q3 传统的“正向生物学”遵循“功能蛋白 AlignmentModeler)等都是常用的运算法则.有些公 -mRNA/cDNA-Genome”的研究顺序，首先应用生 司提供在线的基因组比对(comparativegenomics)服 化技术获取纯化的功能蛋白，然后借助mRNA逆 务，如VISTA计算工具.IL-19和IL-20的发现都是 转录得到cDNA，从而获得功能基因的序列并最终 通过使用高效的运算法则，从GenBank或者TIGR 获取基因在染色体上的定位及结构.在人类基因组 数据库中筛选功能DNA序列得到cDNA序列的. 测序工程完成后，一些实验室开始探索新的研究功 1.1.2 利用染色体基因分布结构的特点进行新基因 能基因的方法，即在染色体上探测可能有潜在功能 的探索.基因在染色体上的分布常常是成簇的.一些 的序 列 ，逆 向沿 着 “Genome-mRNA/cDNA- 功能相同或相近的基因位于同一染色体的同一位 protein”的研究顺序进行研究，被称之为“反向生 置，组成一个基因家族.因此，功能基因家族簇附 物学”.反向生物学的发展与大量免疫相关功能基 近的DNA序列中隐藏着未知功能基因的可能性比 因的发现密切相关，有很多利用反向生物学手段发 较高.例如，IL-21、IL-2、IL-15的基因位于同一染 现的新基因都是具有免疫学活性的细胞因子或者调 色体上，人 IL-21基因位于染色体4q26-27，IL-2 节蛋白.本文提出“反向免疫学”的概念，综述反 基因定位于 4q26-28，两者仅相隔 180kb，而 向生物学技术在免疫学领域的应用. IL-15基因则位于IL-2和IL-21基因的末端，4q31. IL-2与IL-21结构非常相似，二者受体也非常相似. 1 功能基因的发现 IL-21R最初作为一个新的一类细胞因子受体引起 人类基因组测序工作提供了大量关于人类染色 [1] 人们的注意就是因为它与IL-2受体的相似性 .另 体组的信息.为了从冗长复杂的染色体DNA序列 [2,3] 外IL-10家族基因也成簇分布于两个区域 . 上寻找有功能的目的基因，需要有效的、高通量的 1.2 转录组学方法 分析技术. 消减杂交与基因芯片等差异表达基因克隆技术 1.1 基因组学方法