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力、苯酚羟化酶、邻苯二酚1,2-双加氧酶酶活的差异,推测off8的功能。其结果,在
受8mM苯酚,而突变株能耐受12mM苯酚。随着苯酚浓度增加,延滞期增长,同一苯酚
浓度下,突变株的延滞期明显短于野生型,液体培养条件下,突变株60h可以将4mM
的苯酚完全降解,而野生型菌株只降解了68%。由此推测off8在苯酚降解过程中起负
词节作用。
苯酚降解调控蛋白MphR的克隆及其调控机制的研究
彭子欣陈明张维王劲林敏
中国农业科学院生物技术研究所北京100081
苯酚等酚类化合物通常发现于工业或其它污水中,对人类健康和生态环境都有巨
大、直接和潜在的危害。某些微生物可经济有效的将此类污染物降解或转化为无机物,
消除其对环境的不利影响。本实验室于2000年从炼油厂排出的废水中分离到一株高效
降解苯酚的菌株醋酸钙不动杆菌PHEA一2,克隆到包含全部苯酚羟化酶基因(口础)的10
蚰片段,在其上游有—个不完整的开放阅读框ORFI,其推导的氨基酸序列和醋酸钙不
反向PCR技术将已知10kb片段向上游延伸了3kb,得到完整的ORFI,序列长1671bp,
编码556个氨基酸,蛋白分子量63,380Da,定名为MphR。
激活蛋白(EBR)成员有很高的相似性,与MopR同源性最高,碱基序列同源性达到68.45%,
氨基酸同源性达到78.75%。NtrC/XylR型调控蛋白的调控系统申,调控蛋白和酚类化合
物相互作用激活降解基因的启动子。调控蛋白结合于启动子的增强子序列(UAS),当调
控蛋白识别到效应物后,多聚化形成六聚体结合于UAS序列,DNA弯折促使调控蛋白和
RNA聚合酶紧密接触,激活依赖玎5‘RNA聚合酶的启动子转录,表达降解酶。这种蛋白
在结构上从N端到C端分为具有相应功能的A、B、C、D四个独立的结构域:化学信号
域、链接域、KNA聚合酶激活域和DNA结合域。对这个家族的调控蛋白分析表明,效应
物在A域的结合导致C域的脱阻抑,阻抑物的释放使C域结合ATP,接着在UAS序列发
生ATP驱动的多聚化和脱多聚化,促使盯“RNA聚合酶和盯5‘启动子形成开放复合物,
起始基因表达。
源性最高达72%,但它们的效应物识别谱不同。苯酚存在对,MphR在大肠杆菌中可以
理一致。MphR识别苯酚效应物后结合于P。,激活它的表达,凝胶阻滞试验验证了MphR
和P。的结合。
序列,调控蛋白结合的UAS序列在一24/一12位点上游100bp左右,由两个反向重复序
列(IR)组成,每个IR长16bp,两个IR间隔29到42bp,根据这些特点推测出启动
子基本组件的大致位置。通过巢式PCR分别对启动子区5’和3’端逐段截短确定了启
动子组件的准确位置和其最小功能区域为220bp。5’端第一个IR序列左臂的缺失导
致启动子功能完全丧失;3’端至少需保留起始密码子ATG后20个碱基序列。凝胶阻滞
试验进一步证明截短UAS序列的启动子片段不能与调控蛋白结合,研究结果显示MphR
通过与苯酚信号分子的相互作用,激活苯酚羟化酶启动子,调控表达苯酚的降解代谢途
● ●
径。
运动发酵单胞菌果聚糖蔗糖酶保守区氨基酸残基突变对其产
物聚合度的影响
周正富李淑英张维林敏
中国农业科学院生物技术研究所北京100081
100
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