花生叶全长cDNA文库的构建和部分表达序列标签分析.pdfVIP

福建农林大学学报(自然科学版) 第43卷第6期 of and Science 2014年11月 JournalFujianAgricultureForestryUniversity(NaturalEdition) 花生叶全长eDNA文库的构建和 部分表达序列标签分析 陈华1，蔡铁城1，张冲1，邓烨1，熊发前2，唐荣华2，周双彪1，庄伟建1 (1．福建省作物分子与细胞生物学重点实验室，福建福州350002； 2．广西农业科学院经济作物研究所，广西南宁510225) 摘要：以‘闽花6号’品种为材料，利用SMART技术成功构建了花生叶不同生育时期混合的全长eDNA文库，并对文库的部 分序列进行测序及分析．结果表明，该文库原始库容为2．25×106 bp，平均插入片段大小为1000bp，达到文库质量要求．随机挑选50个单克隆进行5’端测序，共获得50条有效序列．通过与 NCBI非冗余蛋白质数据库进行比对和注释，获得已知功能基因或具推测功能的基因25个，未知功能基因14个，新基因11 个，其中49个(98％)基因为花生未报道的基因．参与代谢过程和胁迫响应的基因表达量较高． 关键词：花生；SMART技术；全长eDNA文库；叶；表达序列标签 中图分类号：S565．2 文献标识码：A 文章编号：1671-5470(2014)06-0596-06 and ofleaves cDNA in Construction full-lengthlibrarypeanut analysis CHEN Hual，CAI Chon91，DENGYel，XIONGFa—qian2， Tie．chen91，ZHANG TANG Wei-jianl Rong—hua2，ZHOUShuang．bia01，ZHUANG Provincial of MolecularandCell (1．Fujian KeyLaboratoryCrop Biology，Fuzhou，Fujian350002，China；2．CashCrops Research of 530007，China) Institue，GuangxiAeadamyAgriedturMSciences，Nanning，Guangxi leafeDNA waseorIstmctedwiththeleavesofArachis CV．Minhua6 SMART Abstrad：Apeanut library hypogaea using technique· The hadatiterof2．25×106cfu·mL～．ofwhich100％clorleswererecombinantandinserteDNAswerefrom750 originallibrary tO2000with about1000 clonesfromtheeDNA were and50valid were leIlg,th bp bp average bp．Fifty librarysequenced sequences resllltsindieatedthat knownor functional unidentifiedand generated．Sequen