2008—2012年江西省麻疹病毒分离株N基因特征分析.pdfVIP

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2008—2012年江西省麻疹病毒分离株N基因特征分析.pdf

· 908 · 现代预防医学2015年第42卷第5期 ModemPreventiveMedicine,2015,Vo1.42,NO . 5 · 疾病预防控制 · 2008—2012年江西省麻疹病毒分离株 N基因特征分析 施勇,熊英,李健雄,张艳妮,周琚,周顺德,龚甜 江西省疾病预防控制中心,江西南昌330029 摘要:目的 分析江西省麻疹病毒分离株的分子生物学特征,掌握该省 目前麻疹病毒流行株的基因特性。方法 采用 VeroS/LAM细胞对2008—2012年疑似麻疹患者咽拭子标本进行麻疹病毒分离,分离到的毒株通过RT—PCR方法扩增麻 疹病毒核蛋白 (Nucleoprotein,N)基因,并对扩增出的核苷酸序列进行测定,与GenBank中麻疹病毒各基因型参考株 比较并分析毒株变异情况。结果 2008—2012年江西省麻疹病毒分离株均为麻疹 H1基因型,属于我国麻疹病毒的优 势株。l3株分离株之间N基因氨基酸的同源性为98.1%~100%;与H1基因代表型China93—7的N基因氨基酸同源 性为97.5%~98.7%;与中国疫苗株沪 191株的N基因氨基酸同源性为 95.O% 96.2%。结论 2008—2012年江西省麻 疹病毒流行株为H1基因型,说明江西省近年来麻疹的流行株仍然是H1基因型。 关键词:麻疹病毒 ;核蛋 白;基因型;序列分析 中图分类号:R181.3 文献标志码 :A 文章编号:1003—8507(2015)05—0908—04 GeneticcharacterizationofNgenefrom wide-typemeaslesvirusesisolated inJiangxiProvince,2008-2012 SHIYong,XIONGYing,LIJian—xiong,ZHANGYan—ni,ZHOUJun,ZHOUShun—de,GONGTian ProvincialCeriterforDiseaseControlandPrevention,Nanchnag,Jinagxi330029,China Abstract:ObjectiveToanalyzemolecularbiologycharacteristicsofmeaslesvirusisolatedandmasterthegeneticchraacteristicsof measlesepidemicstrainsinJiangxiProvince.MethodsMeaslesviurswasisolatedfrom throatswabsofsuspectedmeaslespatients rfom 2008to2012usingVero/SLAM ceHs.RT-PCR methodwasemployedtoamplifyN genefragmentofmeaslesisolatesfor sequencing.Thenthehomogeneityofthesequencebetweenhtesemeaslesvirusandtherepresentativestrainswitheachgenotypein GenBankwereanalyzed.ResultsAllmeaslesvirusisolatedinJiangxiProvincerfom 2008to2012belongedtogenotypeH1,which hadbeenamaingenotypeinChina.Theisolatesshared98.1%一100% identityofaminoacidsequenceonNgen.Whencomparedto thevirusofH1genotypestrain(China93-7),hterewere97.5%一98.7%homogenetiesonNge

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