富G+和富C+核酸的特异构象研究.pdfVIP

I016 富 G 与富 C 核酸的特异构象研究 李雅鹏 张晓尘 曹宏男 李韡* 王保国 （天津大学化工学院，天津 300072 ） 摘 要 本文利用圆二色光谱(CD)和紫外光谱(UV)等方法，对不同富G序列及其互补富C序列的 特异构象进行了研究。结果表明，K+ + 2+ ,Na ,Mg 等离子对G-四链体结构的稳定有重要影响；而pH值 主要影响富C核酸序列形成的I-motif结构产生影响；DNA分子的这种特异结构，不同于传统的互 补序列所形成的双链螺旋结构；研究DNA分子结构的竞争机制，不仅对于癌症的基因治疗，而且 对于研究开发更高级有序结构的纳米机械与功能器件具有重要意义。 关键词 富 G-DNA G- 四链体 纳米机械 富C-DNA 中图分类号 Q 617 文献标识码 A STUDY ON THE POLYMORPHIC CONFORMATIONS OF G-RICH AND C-RICH DNA LI Yapeng, ZHANG Xiaochen, CAO Hongnan, LI Wei* and WANG Baoguo (School of Chemical Engineering Technology, Tianjin University, Tianjin 300072, China) Abstract Polymorphic conformations of G-rich DNAs and their complementary C-rich sequences were studied under different cationic conditions and pH values by using UV and CD. It + + 2+ was indicated that mono- or divalent cations such as K , Na or Mg greatly affected the conformational of quadruplex of G-DNA, while the I-motifs structure of their complementary sequences were sensitive to pH value variations. Unlike the canonical double-stranded helix, these polymorphic conformations of DNAs suggested the importance of the structural competition between the G-quadruplex, I-motif, and their complementary duplex, which can enlighten us not only on the gene therapy of cancers but also on the assemble of highly ordered nano-machines. Keywords G-rich DNA, G-quadruplexes, nano-machine, C-rich DNA 引 言 生物体内DNA是以其高度的保守性与稳定性著称的，然而实际上DNA分子也是趋于结构的 多形性存在的。 除了通常双链核酸的Watson-Crick反平行螺旋结构之外，某些特定的DNA 序列还能够形成三链[1] [2] 、四链或Holliday十字 等核酸的空间特异结构。特别是其中被广泛研 究的富G核酸序列，研究发现它们能够在体外模拟生理条件下通过鸟嘌呤碱基的Hoogsteen 型氢键力作用形成G-四链体结构[3]，而由富G核酸进一步组装成的G-导线（G-wir