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多肽中氢键性质的理论研究 多肽中氢键性质的理论研究 研究生：齐学洁 指导教师：王长生 学科专业：物理化学 中文摘妻 本文采刚密度泛函理论B3LYP方法，对1i同多肽构象体系进行了理论埘f究。探 讨影响氯键性质的主要阳素，并对氢键键能进{j：了初步什锋：。优化r笄个构致，计算 各个结构的单点能。本论丈主要研究了以F)L个方面： O--C结构的各个原子电荷进行了I|Jf究，讨论r能影响氢键性质的箨刊·…豢，计分 析了导致氢键强_唼：性质协剧性的。E蜚原川。 2)分别以含有甲基侧链平¨无咔I基侧链的一：从以及_：¨二肽±^构为l{J|=究刈象，蟊：保持其他 位置原子不变的情况r，HjC原子取代形成氢键的N原f，以全铡展结构作为基 准，初步估葬了“氢键键能”：HJ与形成氢键的O原f同土族的S原，=墩代O原 于，仍然以全铺艇结构作为基准，剀步1I|i弹r“氢键键能”。 关键词； 密度泛函理论 氢键酸度 协同效腑 氢键键能 多肽中氢键性质的理论研究 刖罱 氢键是一种非常重要的作用，它在生物分子的结构和功能方面都起着非常重要的 作用，氢键不但广泛的存在于水中，而且很多生物分子通过氲键和水发生相互作用． 同时许多生物分子本身也通过氢键的相互作用而展现出一定的结构．因而通过对水中 氢键、生物分子与水形成的氢键．以及生物分子之间的氢键的研究就显得十分重婴。 是强的化学键(如共价键，离子键)与弱物理相互作用(如诱导力和色散力)之间的 过渡；它比一般的化学键弱，但足比分子11；I】的物理桂|珏作用强‘““。它代表了·个质 子给体与一个质子受体之间的相互作用的关系。由于氧键键能介于一般共价键与范德 华作用力之间，因此，一般认为氢键不同于范德华力，是以静电相互作用为主的有方 向性和饱和性的较强作用力，故可称其为一种特异的键型。 随着对分子相互作用研究的逐步深入，一些小分子或大分子的特殊结构特征的出 现促使人们对氢键的定义加以不断的扩艘。人们较早接受的概念是x·l{…Y中的x 和Y都是电负性较高、半径较小的原子，如F．0．N等”1。后来发现，C在某些特 也可以生成微弱氢键；还发现了Ott2…Ptt 的存在【”。在实验巾还发现．基团C。H也能够作为质子供体而形成氢键15-8J，．剧忿蛋 白质和一些小分子中没有观测到的x．H…Ⅱ相互作用也被很多理论所证明…41； 环上)或附属于一个带正电荷的基团的时候，C·H一丁r相互作用将明显得到加强。 一般说来分子形成氢键必须具备两个基本条件：第一、分子中必须有一个与电负 性很强的元素(x)形成强极性键的氢原f；第二、另一个分子中必须有I乜执性人、 带孤对电子且原子半径小的元素(Y)(如F、O．N)等。 能眵形成氢键的物质非常广泛，如水．醇．胺、羧酸．无机酸、水合物．馘台物 等。同生命现象密切相关的蛋白质和核酸结构中，也存在着氢键。氢键的形成情况多 多肽中氢键性质的理论研完 f_二壤分丁阃氢诎，如_二紫V醉“Icoo¨)】 氯键卜厂叫黼碱键鼹F‘ ≮种分予闻氧键 如氨水中的洲，．H2。分于 多肽中氢键性质的理论研究 能数量级相同，既不太强，吐王不太弱，这对于生物高分子功能的发挥是很重要的；@ 交换性：氢键的主键部分可以与次键部分发生翻转，即X-H…Y—x…H—Y；⑦协同 性：氢键在生物体内往往表现出某种‘‘社会性”一一协同关系1”1。 例如：在血红蛋白分子中，“口袋”的大小正好能容纳带有传递氧的铁原于的血红索 基团；具有螺旋形状的a一角元和骨胶分子能使羊毛和毛发变得强有力，并能使腱和I 皮肤强韧．正是氢键．它使DNA双链成为烈螺旋体一一因『iif使分子能自我复制。这 是遗传的基础。由于氢键在生命体中的广泛存在，因此，氢键在人类和动植物的生理 化过程中扮演着重要的角色。而且，对于生命运动，氢键是阐明生命与非生命．生命 因果律，以至重建生命的契机。