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生物亲缘关系探索及思考 摘要 Abstract引言 Introduction 2 材料与方法 Materials and methods 1 生物进化论 一切生物都能发生变异，至少有一部分变异能够遗传给后代。任何生物产生的生殖细胞或后代数目要远远多于可能存活的个体数目；而在所产生的后代中，那些最具有适应环境条件的有利变异的个体有较大的生存机会，并繁殖后代，从而使有利变异可以世代积累，不利变异被淘汰。 2 现代系统发生学 利用从遗传物质中提取的信息作为物种特征具体地说就是核酸序列或蛋白质分子 3 利用MEGA4软件进行序列分析及构建进化树 序列分析是生物学和生物信息学中的重要核心内容. 序列分析是指从核 酸和蛋白质的序列出发，得到它们的结构和功能信息，从而了解核酸和蛋白质在生物体中的作用，并研究它们的进化起源. 例如，同源搜索是从目的核酸和蛋白质序列出发，在海量的数据库中搜索与其可能同源的核酸和蛋白质，研究目的核酸和蛋白质的结构和功能. 又例如，序列比对是应用数学原理找出两条或多条序列之间的保守区域，从而分析它们可能保守的重要结构和功能位点. 4 探索动物间的亲缘关系 （1）分析序列来源（序列来源：老师办公网给的） （2）用ClustalW做多序列联配 （3）标注不匹配区域 NJ法 构建进化树，重复800次 5用同样方法探索与人类亲缘关系最近的动物 （1）原始序列（来自NCBI数据库) NJ法构建进化树 6 用上述方法探索不同地区人类 （1）原始材料(NCBI数据库） (2)构建进化树 3结果与讨论 在自然选择的过程中，生物的性状发生改变，并逐渐形成新的物种，但很明显，即使是不同物种之间，他们仍然在遗传上体现出一定的相似性，本文中所进行的蛋白质序列比对正证明了这一点。 在第一个实验过程中，我们发现各种动物以及人类之间的蛋白质序列分析结果显示，他们都有着一定程度的相似性，比如牛，猪，羊，马的相似性就很明显，尤其是牛和猪之间。 第二个实验结果显示，在血缘关系上，人类同黑猩猩，，长臂猿等灵长类生物体现出很大的相似性，尤其是与黑猩猩之间，相似程度极高。 从第三个序列分析的结果中我们可以看到，不同国别地区的人，在遗传上也体现出高度的相似性，比如日本人，韩国人，南部的中国人之间，德国，英国人之间。 综上所述，我们可以认识到，不同地区的人种，乃至不同生物之间，他们的遗传特性会体现较大程度的类似，而结合遗传学说可以得出这样一个结论：生物起源于同一种古生物。 （1）探索生物间亲缘关系，对于我们寻找人类起源有重要意义。 千百年来，人类对自己从哪里来的问题争论不休，提出了很多假说，又倾注全力加以证明。由于猪牛羊等动物与人类在基因组织组成和结构上有一些相似之处，相同功能的蛋白质其对应的基因有高比例的同源性。涉及到了促进动物快速增长﹐提高饲料利用率﹐缩短生長周期﹐提高产子率和产奶量的物质往往是激素类或促激素类产品﹐转入这类产品的基因到动物体后肉蛋奶中残留后效应将很难预料。在经济利益的驱动下，为了追求高产量高利润，使一些产品在现有检测技术还不能很好评定的漏洞下，有些厂家将研究不成熟的基因改造产品推向产业化商业化。投入市场可能存有对人类健康潜在的不安全性和长时间才可以显示出来的不利效应。但是基因改造过的植物，例如大豆、玉米等作物，因为在DNA结构组成上人与植物相差较大。即使改造过的基因在植物体内发生变异，人体食用后的潜在威胁性相对较小。 参考文献： 《Biological Sequences Phylogenetic Trees Constructing 》 （2）《Comparison of Biological Sequences/structures and Construction of Phylogenetic Trees》 （3）《 The Ameliorative Algorithms of Neighbor-Joining Method for Reconstructing Phylogenetic Trees 》 （4）《浅谈生物进化背景下人类的可持续发展 人类起源之争 邹恩民