生物信息学(一门新兴学科).docVIP

撰稿人：黄英武 （解放军306医院） 过涛（清华大学生物信息学研究所） 审稿人：孙之荣（清华大学生物信息学研究所） 1 概述 2生物信息数据库与查询 2.1 基因和基因组数据库 2.2 蛋白质数据库 2.3 功能数据库 2.4 其它数据库资源 3 序列比对和数据库搜索 3.1 序列两两比对 3.2 多序列比对 4 核酸与蛋白质结构和功能的预测分析 4.1 针对核酸序列的预测方法 4.2 针对蛋白质的预测方法 5 分子进化 6 基因组序列信息分析 6.1 基因组序列分析工具 6.2 人类和鼠类公共物理图谱的使用 6.3 SNPs识别 6.4 全基因组比较 6.5 EST序列应用 7 功能基因组相关信息分析 7.1 大规模基因表达谱分析 7.2 基因组水平蛋白质功能综合预测 参考文献 1 概述 当前人类基因组研究已进入一个重要时期，2000年将获得人类基因组的全部序列，这是基因组研究的转折点和关键时刻，意味着人类基因组的研究将全面进入信息提取和数据分析阶段，即生物信息学发挥重要作用的阶段。到1999年12月15日发布的第115版为止，GenBank中的DNA碱基数目已达46亿5千万，DNA序列数目达到535万；其中EST序列超过339万条； UniGene的数目已达到7万个；已有25个模式生物的完整基因组被测序完成，另外的70个模式生