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中国教育科研网格计划ChinaGrid进展 金 海 华中科技大学计算机学院 hjin@ ChinaGrid：中国教育科研网格 教育部发起，在十五“211”二期支持下启动 得到国家科技部863高性能计算重大专项支持 目标：充分利用“中国教育科研网CERNET”优良的基础设施和它上面丰富、优质的各类资源，在中国乃至全世界建设一个最大、最先进、最实用的网格 首批12所学校参加，目前已经发展成为20所高校 已经初步形成5类典型应用 生物信息学，图象处理，计算流体力学，大学课程在线，海量信息处理 中国教育科研网(CERNET) 中国第二大IP主干网 36个PoP覆盖了所有省会城市 主干网为2.5Gbps DWDM 总出国带宽超过800Mbps 覆盖了200多个城市的1,300多所大学 1500多万用户 中国多数高校有自己的校园网 CERNET-1的总体结构 建设内容 校园网格平台建设 ChinaGrid网格公共平台建设 网格应用平台及其典型应用建设 图像处理网格 生物信息学网格 大学课程在线网格 计算流体力学网格 海量信息处理网格 ChinaGrid（第一期） ChinaGrid (现在) 各学校网格平台建设情况 华中科技大学：0.8万亿次，5TB 清华大学：1.3万亿次，20TB 北京大学：1.5万亿次，10TB 北京航空航天大学：0.7万亿次，10TB 华南理工大学：0.9万亿次，20TB 上海交通大学：0.5万亿次，9TB 东南大学：1.0万亿次，19TB 西安交通大学：0.1万亿次，2.5TB 国防科技大学：0.2万亿次，5TB 东北大学：0.8万亿次，5TB 中山大学：1.3万亿次，10TB 山东大学：1.3万亿次，18TB 西北工业大学：0.4万亿次，2TB 浙江大学：0.6万亿次，3TB 复旦大学：1.8万亿次，6TB 同济大学：0.2万亿次，1TB 中国科技大学：1.2万亿次，5TB 电子科技大学：0.3万亿次，2TB 中国人民大学：0.1万亿次，0.5TB 兰州大学：0.3万亿次，1TB ChinaGrid总体部署图 什么是CGSP？ ChinaGrid Supporting Platform, 为ChinaGrid建设和发展而研制的网格核心中间件 符合OGSA架构，参照WSRF规范实现 CGSP预览版在GCC2004上公布，1.0版本在2005年1月10日发布 CGSP开发组由华中科技大学、清华大学、北京大学、北京航空航天大学、上海交通大学的开发人员联合组成，在清华大学信息技术国家实验室封闭开发半年 目前已经有生物信息学、图像处理、计算流体力学等的应用在该平台上调试通过 CGSP的应用现状 从CGSP发布到现在，CGSP已经被下载超过300次 目前ChinaGrid的所有学校校园网格平台已经全部采用CGSP，成为国内第一个统一网格平台的国家级网格系统 ChinaGrid公共支撑平台体系结构 ChinaGrid公共支撑平台CGSP 1.0 CGSP的国际影响 ChinaGrid已经和Globus联盟签订了MOU，将展开网格中间件的全面合作 英国e-Science计划表示将CGSP作为e-Science重点研究的网格中间件之一 德国的D-Grid项目将和ChinaGrid合作，采用D-Grid的Unicore客户端和CGSP服务器端 新加坡拟与ChinaGrid展开访问网格的合作 包括HP、Intel、Sun、IBM等在内的国际知名IT公司都纷纷寻求和ChinaGrid展开合作 AG4ChinaGrid进展：GridAsia 2005 生物信息学网格 生物信息学网格应用 Euler大规模DNA序列拼接（清华大学） SARS病毒序列分析（清华大学） 人类心血管相关基因的大规模分析（华中科技大学） 蛋白质三维结构预测（华南理工大学） 全基因组图谱拼装（国防科技大学） 人类基因多态性研究及应用示范（西安交通大学） 玉米雄性不育系的蛋白质组特征分析与应用示范（西安交通大学） 序列比对（没有网格） 查找到能够提供序列比对服务的服务器 登陆该服务器 学习使用方法 查看数据库的更新时间 提交计算任务，获取计算结果（花费大量时间） 重复以上3步，直到获取所有可访问服务器的比对结果 分析结果，根据数据库的更新时间，去除重复的结果（花费大量时间） 网格环境下的序列比对 用户使用简单 通过网页提交任务 等待获取最终的计算结果 系统自动更新和同步 每天晚上12：00国内数据库通过CERNET从美国数据库更新数据库，保持同步 每天早上凌晨4：00国内相关数据库相互更新，保持同步 用户最后获取唯一比对结果，无需去除重复比对结果 系统自动分割任务 效率大大提高 多台服务器同时比对序列的不同部分；计算结果最后整合 没有重复比对操作 图像处