肝、肾移植受者外周血基因表达差异分析.pdfVIP

·166·doi JSouthMed i0．3969／j．issn．1673—4254．2013．02．02 基础研究 肝、肾移植受者外周血基因表达差异分析 徐洪来1，肖敏2，杨超1，高义1，雒真龙1，周鸿敏1，陈忠华1 1华中科技大学同济医学院附属同济医院器官移植研究所，湖北武汉430030；2华中科技大学同济医学院附属 协和医院皮肤科，湖北武汉430022 摘要：目的探讨肝移植与肾移植受者外周血免疫细胞基因表达差异。方法从GEO数据库获取27个肝移植受者及25个肾移植 受者外周血的基因芯片表达谱数据。应用GSEA软件进行基因集富集分析，应用Cytoscape软件对差异基因进行生物网络分 析，获得肝、肾移植相关核心基因。结果GSEA分析筛选出肝、肾移植领头亚群高重叠基因各20个。差异基因生物网络分析， 筛选出肝、肾移植相关中心蛋白质(基因)数目分别为14及13；结合GSEA及生物网络分析结果，获得核心基因各5个。结论外 周血免疫细胞的转录、翻译调节机制在肝移植免疫调节中发挥了更重要的作用，而在肾移植信号蛋白质的相互作用网络发挥了主 要的免疫调控功能；免疫细胞的能量代谢与免疫调控存在密切关系；外周血肝、肾移植核心基因发挥了重要的免疫调节功能。 关键词：肝移植；肾移植；基因表达谱；基因集富集分析；生物网络 Differencesin blood betweenliverand peripheral expressionprofiles kidney gene transplantation recipients XU Min2,YANGCha01，GA0Yil，LUO Honglail，XIA0 Zhenlon91，ZHOUHongminl，CHENZhonghual 1Institute Medical and Transplantation,Tongji College,HuazhongUniversityo／Science o／Organ Hospital，Tongji Medical Scienceand od of Technology, 430030,China；2DepartmentDermatology,UnionHospital，TongjiCollege,HuazhongUniversity Whhan430022．China To the in ofthe immunecellsbetween differencesthe blood Abstract：Objectiveinvestigate geneexpressionprofilesperipheral liverand Adataset the of27liver kidneytransplantationrecipients．Methodscontaininggeneexpressionprofiles and25 GSE22229and transplantationrecipients kidneytransplantationrecipients(fr