探究自然选择和人工选择作用于藏猪与家猪线粒体基因组的痕迹.pdfVIP

四川省畜牧兽医学会2014年学术年会 探究自然选择和人工选择作用于藏猪与家猪 线粒体基因组的痕迹 金 龙¨李明if|l¨马继登1田仕林2 李瑞强2 李学伟h (1．四川农业大学动物科技学院，四川雅安625014； 2．北京诺和致源生物信息科技有限公司，北京 100083) 摘 要 藏猪主要分布于中国西藏自治区的山南、昌都地区和拉萨市，四川省的阿坝和甘孜藏族自治 州，云南省的迪庆和甘肃省的甘南藏族自治州等平均海拔达3000米以上的高海拔地区，能够很好的适应低 氧、低温、强紫外线等恶劣环境。本实验采用35对引物，利用常规Sanger测序技术对6个不同地区藏猪及4 个四川地方猪种的线粒体基因组进行了测序和拼接。同时，结合数据库中14个代表性猪种的线粒体DNA 序列进行系统发育分析，发现藏猪与四川地方猪种亲缘关系较近。采用slidingwindows的方法比较了藏猪 与四川地方猪种线粒体基因组不同区段的核苷酸多样性，发现在线粒体DNA多达76．9％的区域中，藏猪的 核苷酸多样性显著高于四川地方猪种，充分反映了家猪受到强烈的人工选择，而藏猪由于极少受到人工选择 而保持了较高的线粒体DNA多样性