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环境微生物基因组学的生态学管窥.pdf
中国t奄农土季报2008年9月第16卷第5期
ChineseJournalofEco-Agriculture，Sept．2008，16(5)：1322-1325
DOI：10．3724／SP．J．1011．2008．01322
环境微生物基因组学的生态学管窥·
张黎 周 青”
(江南大学环境与土木工程学院环境科学研究室无锡214122)
摘要 自然界约99％的微生物不能通过传统的分离筛选途径进行培养(即未培养微生物)，为获得新的基
因资源，更全面地认识微生物多样性和微生物在自然环境和生物圈中的重要作用，近年来随着分子生物学的
快速发展及其在微生物研究中的广泛运用，以环境中未培养微生物为研究对象的新兴学科——环境微生物基
因组学成为国内外学者的研究热点。本文介绍了环境微生物基因组学的分析研究策略及生态作用：从环境样
品中直接提取所有微生物的总DNA，采用适宜的载体克隆到宿主细胞中构建宏基因组文库，再筛选新的活性
物质或基因；从生态学角度分析微生物不可培养的原因，可利用环境微生物基因组技术进行土壤污染修复、畜
禽养殖除臭、鉴定新物种以及确定特定生态环境体系中未培养微生物种群与群落的结构组成及物种的进化
模式。
关键词 未培养微生物 环境微生物基因组 基因组文库 微生物生态作用
中图分类号：S1 文献标识码：A 文章编号：1671—3990(2008)05—1322—04
of inmicrobialresearch
Ecologicalapplicationmetagenomics
ZHANG
Li，ZHOUQing
ofEnvironmental ofEnvironmentalandCivil
(Laboratory Science，School Engineering，
University，Wuxi214122，China)
Jiangnan
or notbe
AbstractInthe havenotbeencan culturedtraditional
environment，about99％microorganisms by cultivation印-
the ofmolecularandits in newresearchfieldof has
proach．Withdevelopment biology applicationmicrobiology，a metagenomics
from
isolationandcultivationofrelative environmental librariesare
emerged．Without
prior microorganisms samples，metagenome
constructed from itto uncuhur-
DNA environmentaland host．Thisreview
byextracting samplestransformingsurrogate explains
of fromthe of canbeusedforbioremediationof soilsanddeodoriza·
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