一种绿色真江蓠的分子鉴定.pdfVIP

第３３卷　第２期 应 用 海 洋 学 学 报 Ｖｏｌ３３，Ｎｏ２ 　２０１４年５ 月 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｏｃｅａｎｏｇｒａｐｈｙ Ｍａｙ，２０１４ 一种绿色真江蓠的分子鉴定 钟晨辉，黄瑞芳，林　琪，郑雅友，李雷斌，刘　波 （福建省水产研究所、福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室，福建 厦门３６１０１３） 应用 ｒＤＮＡＩＴＳ 和线粒体 ｃｏｘ１ 片段扩增序列，分析了厦门杏林湾的２ 株绿色未知江蓠 摘要： （Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｓｐ．；四分孢子体ＧＲ１ 和雌配子体ＧＲ２）及２株紫褐色真江蓠（Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ；四分 孢子体ＰＵ１ 和雌配子体ＰＵ２）．运用ＭＥＧＡ５．０估算了４ 个供试样本与 ＧｅｎＢａｎｋ 中相似度最高序 列的遗传距离并构建了系统发育树．ＩＴＳ序列分析显示绿色未知江蓠ＧＲ１、ＧＲ２ 都与真江蓠聚集 在一起，推断两者与真江蓠的亲缘关系非常近．ｃｏｘ１ 片段序列分析表明，绿色未知江蓠ＧＲ１、ＧＲ２ 和紫褐色真江蓠 ＰＵ１、ＰＵ２ 都与索引的真江蓠聚集在相同类群．其中ＧＲ１、ＧＲ２ 与真江蓠 ＪＱ６１９１４２、ＪＱ６１９１４３ 的相似度都为１００％，它们之间的遗传距离范围在０．０００ ～０．００２，低于种群内 部的遗传距离范围０．０００ ～０．０１５，从分子水平上确定了绿色未知江蓠是真江蓠．联合 ＩＴＳ 和ｃｏｘ１ 片段序列的分子标记适用于真江蓠的种质鉴定． 海洋生物学；真江蓠；绿色；ＩＴＳ；ｃｏｘ１；分子鉴定 关键词： ＤＯＩ：１０．３９６９／Ｊ．ＩＳＳＮ．２０９５４９７２．２０１４．０２．００５ 中图分类号：Ｐ７３５ 文献标识码：Ａ 文章编号：２０９５４９７２（２０１４）０２０１８３０７ 　　江蓠科（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ）海藻是我国沿海地区广 切的种质鉴定．ＩＴＳ 序列包括ＩＴＳ１ 和ＩＴＳ２ 两部分， 泛自然分布和栽培的大型经济红藻，包括真江蓠 两者之间由高度保守的５．８Ｓ ｒＤＮＡ相连，由于进化 （Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ）、细基江蓠（Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉ 相对迅速而具多态性，适合于等级水平较低的系统 ｔａｔａ）、细基江蓠繁枝变种（Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ｖａｒ．ｌｉｕｉ）、 ［１９］ 学研究 ．ｃｏｘ１ 是线粒体基因中的细胞色素ｃ 氧化 ［１３］ 龙须菜（Ｇ．ｌｅｍａｎｅｉｆｏｒｍｉｓ）等２０ 多种江蓠 ．江蓠 酶第１ 亚基基因，比核基因组突变率更高，用以分析 科海藻种类多，由于缺乏充足的形态学和生殖器官 ［２０］ 物种间的进化关系 ．因此，本研究采用了ｒＤＮＡ 结构特征，加上种内藻体还存在自然生态变型，形态 ＩＴＳ 和线粒体ｃｏｘ１ 基因片段的双分子标记 ＰＣＲ扩 变化复杂导致难以用传统的分类方法进行种质鉴 增序列，与 ＧｅｎＢａｎｋ 数据库内江蓠科海藻相关的 定［４６］．随着现代分子生物学的快速发展，基于分子 ＩＴＳ和ｃｏｘ１ 片段序列进行 ＢＬＡＳＴｎ 比对和系统发育 ［７８］ ［７］ ［７，９１１］ 水平的１８Ｓ ｒＤＮＡ 、ＳＳＵ ｒＤＮＡ 、ＩＴＳ 、ＲｕＢｉ 分析，对绿色未知江蓠和紫褐色真江蓠进行了分子 ［１２］ ［１３１５］ ［１６１８］ ｓｃｏ 、ｒｂｃＬ 、ｃｏｘ１ 等序列标记，已被运用到 水平的遗传分析和种质鉴定，旨在明确该绿色江蓠 江蓠科海藻的系统发育关系研究以及江蓠种质鉴定 的确切种质，为其种质发掘与利用提供基础资料． 和