东太平洋海隆深海热液区沉积物古菌多样性分析.pdfVIP

第３３卷　第４期 应 用 海 洋 学 学 报 Ｖｏｌ３３，Ｎｏ４ 　２０１４年１１ 月 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｏｃｅａｎｏｇｒａｐｈｙ Ｎｏｖ．，２０１４ 东太平洋海隆深海热液区沉积物古菌多样性分析 刘　青，谢运标，陈逍遥，周梅先 （国家海洋局第三海洋研究所、国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室，福建 厦门３６１００５） 采用ＰＣＲＲＦＬＰ方法对东太平洋海隆深海热液区３ 个站位沉积物中的古菌多样性进行了初步 摘要： 研究．结果显示，从古菌１６Ｓ ｒＲＮＡ基因文库中随机挑取的２９６ 个阳性克隆分属奇古菌门（Ｔｈａｕｍａｒ ｃｈａｅｏｔａ，４７．６４％）、广古菌门（Ｅｕｒｙａｒｃｈａｅｏｔａ，４４．９３％）、泉古菌门（Ｃｒｅｎａｒｃｈａｅｏｔａ，６．７７％）和未分类 古菌（０．６８％），其中优势菌群为奇古菌门的亚硝化侏儒菌属（Ｎｉｔｒｏｓｏｐｕｍｉｌｕｓ，３５．４７％）和广古菌门 的热原体纲（Ｔｈｅｒｍｏｐｌａｓｍａｔａ，２７．０３％），ＤＨＶＥ３、ＤＨＶＥ５、ＤＨＶＥ６、ＭＢＧＢ和ＭＢＧＥ 类群在沉积物样 品中也均有发现．另外，３ 个站位沉积物中古菌类群组成存在差异，Ｓ５ＴＶＧ１ 站位样品文库的９７ 个 古菌克隆分属奇古菌门（４９．４８％）、广古菌门（４９．４８％）和泉古菌门（１．０３％），Ｓ１４ＴＶＧ１０ 站位样 品文库的１０３ 个古菌克隆由奇古菌门（８４．４７％）和广古菌门（１５．５３％）组成，Ｓ１６ＴＶＧ１２ 站位样品 文库的９６ 个古菌克隆包括广古菌门（７１．８８％）、泉古菌门（１９．７９％）、奇古菌门（６．２５％）和未分类 古菌（２．０８％）．研究结果表明，东太平洋海隆深海热液区沉积物中古菌多样性丰富，存在着许多新 的古菌菌群；不同站位古菌菌群结构以及多样性存在差异，这与其所处环境的热液活动密切相关． 海洋生物学；东太平洋海隆；深海热液区；沉积物；古菌多样性；ＰＣＲＲＦＬＰ分析 关键词： ＤＯＩ：１０．３９６９／Ｊ．ＩＳＳＮ．２０９５４９７２．２０１４．０４．００９ 中图分类号：Ｐ７３５ 文献标识码：Ａ 文章编号：２０９５４９７２（２０１４）０４０５１６０９ ［１］ 　　自１９７７ 年深海热液区被科学家首次发现后 ， 海热液环境的极端特殊性，绝大多数嗜热古菌难以 由于其独特的物理化学梯度特点（高温、高压、含大 在实验室条件下进行分离纯化，因此采用免培养方 量还原性物质）以及与几十亿年前地球生命初期的 法研究深海热液区的古菌多样性为进一步了解深 环境相似，因此深海热液区被喻为研究生命起源与 海热液区生态系统的古菌菌群结构以及获得有价 ［２］ 进化的天然实验室 ．深海热液区蕴含丰富的矿产 值的菌株和基因资源提供了重要依据． 资源，并且栖居着大量的极端嗜热微生物，尤其是 东太平洋海隆区火山活动频繁，分布着大量的 极端嗜热古菌．１ 株来源于印度洋中脊 Ｋａｉｒｅｉ 热液 热液喷口，该区域的微生物资源研究开发是当前海 区的产甲烷嗜热古菌 Ｍｅｔｈａｎｏｐｙｒｕｓ ｋａｎｄｌｅｒｉ ｓｔｒａｉｎ 洋科学研究的热点领域．本文采用 ＰＣＲＲＦＬＰ（Ｒｅ １１６ 的分离使人们对生命生长温度上限（１２２℃）有 ｓｔｒｉｃｔｉｏｎ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｌｅｎｇｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，限制性片断长 ［３］ 了新的认识 ．极端嗜热古菌具有特殊的生理代谢 度多态性）方法对东太平洋海隆深海热液区沉积物 机制并且可产生多种具有工业应用前景的热稳定 样品中的古菌多样性进行研究，以期了解深海热液 ［４５］ 性酶 ，例如分离自深海热液区的甲烷球菌Ｍｅｔｈａ 区沉积物中的古菌菌群结构，促进深