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蓖麻毒素寡核苷酸适配子的CE.SELEX筛选研究
廑直墨,谢剑炜!
(军事医学科学院毒物药物研究所100850北京)
SELEX“2。3技术是一种新的组合化学技术,应用人工合成的随机寡核苷酸文库,通
过筛选、分离、富集获得能与氨基酸、蛋白、药物、有机小分子、无机离子等靶物质特
异性结合的寡核苷酸适配子,且具有高亲和力。相比大分子的抗体,寡核苷酸适配子分
子量小,结构简单,能保证合成的精确性以及易连接其它分子进行修饰,如荧光素、生
物素等。同时,应用寡核昔酸适配子还能克服小分子等物质免疫原性弱,难以产生抗体;
寡核苷酸适配子可以变性、复性且速度快,可反复使用、长期保存。基于寡核苷酸适配
子的这些优点,将适配子作为生物传感器的识别元件,制成适配子生物传感器
(Aptasensors),具有不可替代的优势。
本文将毛细管电泳技术作为分离手段引入到SELEX筛选中,建立了一种全新的
CE·SELEX4筛选模式。这种筛选方法充分利用了毛细管电泳的高效分离能力的特性,极
大地提高了筛选效率,使得传统的SELEX筛选方法需要耗费数个星期,至少进行8一15
轮的筛选缩短为整个筛选只需数天即可。在本实验中,我们体外构建了含40个随机序列
全长87nt的随机ssDNA文库,采用线性聚丙烯酰胺凝胶内涂层的毛细管用作对蓖麻毒索
寡核苷酸适配子筛选分离,仅数天四轮的筛选即得到了特异识别蓖麻毒素蛋白的富集文
库(图1、表1)。克隆、测序得到了1l条适配子全序列,并用同位素标记法测定了其中
3条序列与蓖麻毒素蛋白的亲和力(表2)。这为下一步研制特异识别蓖麻毒素的适配子
生物传感器奠定了基础。
口 i ● ‘ s 1口
Timq(mi∞
oftheDNA observedCE-SELEX
Figurel.Electropherograms selection.The
pool during
ssDNA
WaS
incubatedwith ricinatroom for
pool 10pmol 30minandthemixture
temperature
+通讯联系人:谢剑炜,E-mail:xiejw@rile.brnJ.∞.cn
42
conditions:thebuffer,20mlVl
for5s.CE
were by 50mbar running
applying
samplesinjected
KCI,ImM ImM anddetection
HEPES NaCl,5mM CaCk,andMgClz;一10kV
pH7.1,40raM
wavelength,254nm.
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