藏鸡EPAS1基因的多态性及表达差异分析.pdfVIP

藏鸡剧嗡SJ基因的多态性及表达差异分析 苟文钰，凌遥，张倩，张浩一 (中国农业大学畜禽育种国家工程实验室，北京 100194) 1 引言 近年来，一些学者在全基因组范围内研究遗传变异对高原人低氧适应的贡献，在不同高原民族群体中发现了一 些正选择位点的基因，其中报道最多的是E以|sJ基因，指出该基因碱基的改变能影响高原病产生。E以|sJ基因编码 HIF一2d，在缺氧状态下启动下游靶基因的表达，对血管生成、红细胞增加、能量代谢等方面产生重要作用。藏鸡是我 国青藏高原特有的地方鸡种，对高海低氧环境具有较好的适应性。藏鸡可能与高原人和其他哺乳动物存在共同的低 氧适应分子机制，本文在分析不同鸡种EPAsl表达量，并筛选sNP，以期找到高原低氧环境对鸡群体的正选择位点， 为动物低氧适应分子机制研究提供基础。 2材料与方法 采集日喀则藏鸡、寿光鸡和自来航3个群体血液样品，用苯酚一氯仿法提取基因组DNA。设计引物19对扩增 剧明sJ基因17个外显子、5’端5 000bp和3’端2000bp序列，每个群体10个个体PcR产物等量混池测序，比对分析 sNP，选择相应的内切酶检测群体多态性。采集藏鸡、茶花鸡、寿光鸡3个品种种蛋进行低