第五章对核酸序列进行预测分析.ppt

第五章对核酸序列进行分析预测 生物信息学的几大工具 数据库（ 核酸、基因、蛋白、结构、结构域、抗原抗体、酶等） 各种软件（Aligment, 核酸序列分析、蛋白序列分析、蛋白相互作用预测等等） 这一章 我们要学习 对核酸序列进行分析的各种软件和方法 一段核酸序列上可能有什么？ 我们能用生物信息学对核酸序列进行哪些分析？ 在DNA序列中那些是基因？外显子？内含子？ 这些基因编码什么蛋白？ 这些基因有那些不同，不同会产生什么效果？会不会引起蛋白的改变？ 这一段核酸序列上有没有特殊的功能位点？ 物种之间有什么差距？ 这段序列中是否有重复序列 对特殊性功能位点进行检测 重复序列 外显子 内含子 启动子 CpG岛 甲基化位点 基因预测的基本原则 1、? 如果一个序列中某一区域出现重复序列， 该区域不大可能出现在编码区域。 2、? 如果某一片段与其它基因或基因产物有序列 相似性，该片段是外显子的可能性极大。 3、? 一段序列上存在统计的规则性，表现为 密码子偏好，是蛋白编码区最明显的标志。 4、 与模板模式相符可能指出DNA上功能位点 的位置。 密码子偏好 编码蛋白对某一个物种有偏好使用某一密码子的现象，称为密码子偏好。 重复序列 重复序列对影响着生命的进化、遗传、变异;同时它对基因表达、转录调控