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配体间相互作用研究
一氨基酸与二肽配体形成质子复合物的稳定性与结构‘
张向东何 美 孙锦玉 张锋宋溪明 刘祁涛
(辽宁大学化学系沈阳110036)
形成质子复合物的稳定常数。结果如表1所示。当二肽与氨基酸配体形成1:1型质子复合物时,其平
中的loS届n和los届,t值即为平衡中分别结合1个质子和2个质子时氨基酸一二肽质子复台物的结合常
衡常数log尼和log/E值,结果也列于表1。
表2氨基酸一二肽配体质子复合物稳定常数
[卢(254-0.1)℃./=0.Imol/L(NaNO,)】
PLWly 1249蝴06 20.39i-0.D:j 2 85 342
PL一^In I:l 6C爿)04 2I.2剐珊1H :j.8l 4 13
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I1.一儿e 13:16划).cH 2】.06爿}IH :j.70 4%
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PL—Phe 1213划】∞ 19U1爿)【l{ 2 99 :{14
为了进一步探讨二肽与氨基酸配体间的相互作用规律,采用量子化学和分子力学反复迭代计算法,
优化计算了苯丙氨酰亮氨酸(PL)负离子与六种两性离子型氨基酸配体分子相互作用的空间构型和能
用A!qBER力场。表2列山了计算所得各配体和质子复合物的总能量.n和风或且。当氨基酸与二肽
结合形成质子复合物时.其能量变化应符合公式:AE=E““一(昂+B·)。AE值也列入表2。
表2配体和质子复合物的总能最以及质子复合物的结合能(KJ/m01)
91。说明实验测
如果忽略熵的贡献…川AF对logm或IogK,.flz图.其线性相关系数分别达到0.88和0
定与计算结果是基本吻台的。表3进一步列出了计算所得的构成△F的静电.氢键能(△E)范得华能(△蜃)
和来自健间的排斥能(△尽)。从表3数据不难看出,质子复合物形成的推动力主要来自静电和氢键作
0.50。
用。但是,仅用A丘与Iog墨或lo晦相关联,并不能得到好的相关性,其相关系数仅分别为O.52羽1
这说明虽然氨基酸与二肽配体间的氢键·
213
J};|也不可忽视.是儿类作刚共同决定质子化复合物的稳定性。
表3苯丙氮酰亮氮酸一氨基酸质子复合物结合能的构成(KJ/m01)
G】y—PL 一91074 —111069 7 236 12750——
^la—PL 一92816 —102
974 l 73fi 日.422
Vnl一PL 一95.770 ‘107.400 :{43I 8.|99
【le—PL 一9261【l 一105.∞30 {).8】 12429
Leu—PL 一92734 ‘lIm
029 6.562 10733
一坠:!!一一:墨::!翌 :璺:ij :』盟 !:!唑
关键词:氨基酸二肽配体
参考文献
release
1.HyperChem,Hypercuhe
5.1,Hypercuhe,Inc.,Waterloo,
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