黄瓜与甜瓜比较图谱的构建.pdfVIP

园艺学报2009，36(增刊)：2001 AotaHorticuhuraeSinica 黄瓜和甜瓜比较图谱的构建 程周超，顾兴芳‘，黄三文，张忠华，张圣平，苗 晗 (中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081) sativus 黄瓜(CucumisL．)是甜瓜属中惟一一个染色体数为2n=14的种，甜瓜属其它种均为 melo 2n=24。但是黄瓜和甜瓜(Cucumis Mb，甜瓜为480 L．)的基因组大小却相差不多，黄瓜为367 Mb。 比较图谱的构建是比较基因组学研究的重要手段，随着黄瓜全基因组测序的完成和黄瓜高密度 SSR遗传图谱的发表，使得构建黄瓜和甜瓜的比较图谱成为可能。因此本研究旨在利用同一套SSR 标记构建的黄瓜高密度SSR遗传图谱和甜瓜饱和SSR遗传图谱，构建二者的比较图谱，研究标记闯 的保守性，进而推断其进化关系，为黄瓜和甜瓜的比较基因组学研究奠定基础。 根据黄瓜全基因组测序结果开发的2 交系为构图群体，首先对其亲本进行多态性引物的筛选，再通过聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，获得作图 群体各单株的多态性信息，利用JoinMap3．0构图软件分别构建黄瓜和甜瓜的遗传图谱。其中黄瓜高 密度SSR遗传图谱已发表。 结果表明：2 上。对两张图谱标记的保守性进行研究发现，共有12个标记保守区段，且保守区段中各标记间基本 在一个完全倒位现象。 另外，本研究还发现一个普遍的模式，即甜瓜的两个连锁群对应黄瓜的同一条染色体(LG2， 应chr6)。结合以前的研究，发现甜瓜比黄瓜更远古，因此可以推断在黄瓜和甜瓜的进化过程中，甜 瓜的两条染色体相互结合形成了黄瓜的～条染色体，而且在二者的进化过程中，倒位现象的存在也是 推动其进化的一个因素。 本研究仅从分子标记水平上对黄瓜和甜瓜进行了宏观共线性的分析，要想更加深入地对其微观共 线性进行分析，还需要更多的黄瓜和甜瓜的序列信息。 关键词：黄瓜；甜瓜；比较图谱 中图分类号：S 652 文献标识码：A 642．2；S 文章编号：0513-353X(2009)S-20014)1 收稿日期：2009—09—03 ·通讯作者