材料计算软件的.docVIP

材料计算软件的 曙光TC2600刀片服务器解决方案 随着计算机硬件技术的发展和计算方法的突飞猛进，基于量子力学的计算模拟手段已经被广泛应用于化学、材料物理以及有关的其它学科 背景概述 计算化学和材料物理 进入20世纪以后，由于受到物理学理论的飞跃尤其是量子力学的发展的影响， 研究人员广泛地应用了当代科学的理论、技术和方法，在认识物质的组成、结构、合成和测试等方面都有了长足的进展，而且在理论方面取得了许多重要成果。随着计算机硬件技术的发展和计算方法的突飞猛进，基于量子力学的计算模拟手段已经被广泛应用于化学、材料物理以及有关的其它学科在解释和预测材料结构、物理性质和化学行为中。现在根据量子化学计算可以进行分子的合理设计，如药物设计、材料设计、物性预测等。 Kohn和Pople等人开创的密度泛函理论（Density Functional Theory, DFT）在过去的20年里得到了广泛的应用，包括固体物理、化学、生物等学科，都能看到密度泛函理论的影响。与传统的量子力学方法不同的是密度泛函理论的基本变量是单粒子密度，通过体系的单粒子密度而不是波函数来描述体系基态的性质，如总能量等。因此密度泛函理论降低了量子化学计算的计算量。高性能计算已经成为上述领域中的除了理论和实验外的主要研究手段。 曙光高性能由若干台高性能高速网络连接到一起，并通过监控系统和一组机群管理软件对其进行有序管理。C2600 刀片服务器是曙光公司研发的第三代双核/四核刀片服务器产品，它在众多方面超越了传统机架式服务器，是高密度、高性能的新一代服务器产品。刀片服务器由于物理形态上的高度集成，我们可以根据物理化学领域应用的不同的特色进行灵活配置，极大地丰富计算服务器的解决方案。 曙光TC2600刀片服务器提高了机群的计算密度、集成功能和管理能力，提供卓越的计算处理性能、简单方便的部署使用和全方位的监控管理，可以显著提高计算载体的计算密度和管理效率，最大限度地降低科研在IT方面运营和管理维护成本。 独立刀片解决方案 方案概述计算刀片 TC2600刀片柜 1×刀片柜，19”标准，7U，可插10个刀片模块，高可用的机箱中板设计； 台 1 刀片模块 10×计算刀片模块：2×AMD Opteron 2350 四核CPU（主频2.0GHz）2MB L2 Cache，8GB DDRII 533 ECC Register内存, 1×80GB SATA硬盘 交换模块 1×千兆交换模块；每个交换模块可对外提供4个千兆RJ45接口； 管理模块 1×管理模块；可实现共享USB功能、KVM切换、刀片状态、故障定位、开关机等全方位管理控制监视功能； 刀片中文管理软件 基于Web浏览器的管理方式，可提供所有组件的最新状态及图形标示的详细信息；实时状态监控、故障预警，动态优化调整资源配给和工作策略；保存并统计分析关键历史数据；直观显现重要信息的变化趋势；多种错误故障报警方式，日志、审计和报表可供查询；允许加密的远程控制，可从任何位置控制操作及监控整体运行状况 实际原则，从出发，遵照实际情况确定方案的选择与实施。 经济原则，系统采用广泛应用且具有良好性能价格比的产品，既考虑节省投资，又保证产品的先进性和可用性。 扩展原则，系统支持动态扩展，在系统性能需要提升时，可以很方便地进行扩展。 易管理原则，机群服务器的管理非常简便，可以保证系统管理的有序性，高效性，避免管理上的混乱 曙光TC4000高性能计算机 品目 设备名称 组成单元 单位 数量 节点机 计算刀片柜1 曙光TC2600刀片柜 1×曙光TC2600刀片柜，可插10个刀片模块， 台 4 刀片模块 10×计算刀片模块：2×AMD Opteron 2350 双核CPU（主频2.0GHz），8GB内存, 1×73GB SAS热插拔硬盘 网络模块 1×直通网络模块(Pass-though) 1×交换网络模块（Switch Module） 管理模块 1×管理模块 IO节点 曙光天阔A620r-F 2*Opteron 2218处理器2.6GHz，8G内存，2×73G热插拔SCSI硬盘，1×光纤HBA卡 台 1 接入节点 曙光天阔A620r-F 2*Opteron 221处理器2.GHz，8G内存，2×73G热插拔SCSI硬盘 台 1 　控制台视频切换子系统(SKVM) 控制台 内置控制台 19标准，1U，含液晶显示器、8个标准VGA接口、笔记本键盘、笔记本鼠标、标准机柜上架套件 套 1 　网络子系统 高速计算网络 InfiniBand高速网络 1×Infiniband交换机9040，48个4X端口 套 1 4×Infiniband HCA卡10Gb/s，单端口Me