利用Vaxign软件预测幽门螺杆菌疫苗候选抗原.pdfVIP

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2017-08-12 发布于安徽
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利用Vaxign软件预测幽门螺杆菌疫苗候选抗原.pdf

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$1J用vaxign软件预测幽门螺杆菌疫苗候选抗原王艳春，陶好霞，刘纯杰军事医学科学院生物rcA研究所，北京，100071 摘要目的利用Vaxign软件预测和分析幽门螺杆菌潜在的疫苗候选抗原。方法以网站提供的基因组数据为基础，选择参考菌株为幽门螺杆菌26695和J99用Vaxign预测可能的疫苗候选抗原。然后对代表性的蛋白进行系统的生物信息学分析和验证。结果Vaxign软件分析得到34个符合条件的候选蛋白，其中有14个OMP家族蛋白，6个铁离子代谢相关蛋白，3个毒力相关蛋白，2个鞭毛合成相关蛋白和9个假想蛋白。结论Vaxign软件预测结果准确可信，是一个非常实用的疫苗研究工具。Vaxig软件预测疫苗候选抗原这一方法在疫苗研究中有很好的应用前景。关键词Vaxign；幽门螺杆菌；疫苗；候选抗原 HelicobacterVaccineCandidate of inPredictionof pylori ApplicationVaxign Antigens WANG Yan-chunl，JIANGNa2，TAOHao·xial，FENGXiao—yanl，LIUChun-jiel (1．State of and Instituteof KeyLaboratoryPathogensBiosecurity,BeijingBioteclmology,Beijng 100071，China) Authorfor To vaccinecandidate Abstract theHelicobacter predict pylori antigensusingVaxign Objective Two strainswith wereused：strains program．MethodsH．pylori fullysequencedgenomes 26695(RefSeq ID：NC ID：NC were 000921)．MicrobialproteinsequencesanalyzedbyVaxign 000915)andJ99(RefSeq resultwas themanualofthewebsite．The identifiedotherbioinformatics according vaxignprediction by methods．Resultscandidatehavebeen Thirty·four proteins theoreticallypredictedbyVaxignprogram， fourteenOMP ironmetabolism virulence including familyproteins，six regulatedproteins，threeregulated andnine isanaccurateand protein．ConclusionVaxign protei