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网状Meta分析在JAGS软件中的实现.pdf
数理医药学杂志 2014年第 27卷第 4期
or[c,k]~--exp(d[k]--d[c])
2 NMA 的实现步骤
lor[c,k]一(d[k]一d[c])
JAGS软件虽是基于BUGS语言而设定的,但其操作需要 }
全程编程,且在模块、数据及初始值的格式及输入方面与 }
BUGS软件有所不同。因此,为保证正常运行操作,需要对模 处理完毕后 ,将其保存为:“.bug”或 “.jags”格式。本例以
块、数据及初始值的格式在其加载之前进行相关处理。 “ networkmodel”为名、以 “.jags”格式保存在桌面的Rwork文
2.1 模块加载 件夹下。至此,就完成了该软件的模块处理部分。
与BUGS软件 相比,JAGS软件 自身没有排列函数。其 在加载模块之前 ,为了方便操作,可以改变其原始工作 目
模块加载的代码命令为: 录为桌面的Rwork文件夹,具体命令如下:
model cd“C:\Users\Administrator\Desktop\Rwork”
( 至此,所有的操作将默认在桌面的Rwork文件夹中,并可
for(iin1:ns) 以通过下述命令加载模块 :
{ modelinnetworkmode1.jags
w[i,1]一0 上述命令输入后 ,按回车键没有出现任何提示时,则说明
delta-[i,1]一O 模块已经加载完成。
mu[i]~dnorm(o,0.0001) 2.2 数据加载
for(kin1:na[i-]) 加载之前,需要进行数据的排列。JAGS软件中数据的排
{ 列格式与R软件数据排列格式一致 ,本例如下:
r[i,k]~dbin(p[i,k],nil,k-t) t 一 structure(c(1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,
logit(p[i,k1)~--mu[i-l-t-delta[i,k] 1,1,1,l,1,1,l,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,2,2,3,
rhat[i,k]--p[i,k]*nil,k] 3,5,5,5,6,6,6,6,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,7,
dev[i,k]一2*(r[i,k]*(1og(r[i,k])一log(rhat[i, 7,7,9,9,1O,10,11,12,12,12,12,2,2,2,4,4,4,4,
k-I))+(nl-i,k]一r[i,k])*(1og(n-[i,k]一r[i,k])--log(nil,k] 4,5,5,5,5,5,5,5,7,7,7,7,8,1O,10,l1,12,12,
--rhat-[i。k-I)))
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