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运用基因芯片技术研究孕妇TORCH感染.pdf
2006 14 5 ∃ 17∃
TORCH
(南京市妇幼保健院, 南京 210004)
: 本文利用 DNA 引物和探针设计软件 DNAClub 和 Prmi er 50, 根据从 Genbank 中查得的巨细胞 毒
(HCMV 169) 单纯疱疹 毒 (H SV , ) 风疹 毒 (RV) 和弓形虫 (TOX) 基因序列分别设计 16只寡核苷酸探针,
长度 30bp左右, 合成后用简易手动点样仪M icroCaster按 4 !4矩阵点在氨基化玻片上, 制成基因芯片; 将被检测致 微生
物 DNA和质粒载体 DNA 用同一种内切酶切割连接成 ∀ 杂种# DNA, 再利用载体上的通用引物进行 PCR扩增和荧光染料
TM
标记扩增产物, 并将该产物与 DNA 芯片杂交, 用芯片扫描仪 GeneTAC UC4 (Genom ic Solutions Inc) 进行扫描, 利用随机
提供的软件 GeneTAC IntegratorM icroarray Analysis Softw are Version330进行数据处理和分析结果用该种方法制备的基因芯
片可同时检测 5种致 微生物, 将用荧光定量 PCR检测的阳性标本用基因芯片检测结果基本一致
: 基因芯片; PCR扩增; 内切酶; 连接酶
: R3498 : A : 1006 9534 ( 2006) 05 0017 03
TORCH , T 10. GCGTTCCCCGCGGCCGTTGAGACCGCCGTC
( toxoplasm agond i,i Toxo); O ( others) : 11. ACACAGATGGAGCTCGACGCCGCAGACTACGC
B19; R (Rubellavirus, 12. CCTACACCTGCGTGCTGGGCAACGAGACCC
RV), C ( Cytomegalovirus); H 13. GCTACTGGTGTTCCGAATCGTACCGGCGTC
14. GTCCTCGCAGGCCAGCAACTCGCGGAAAGC
(H erper smi p lexvirus, or hum an papillom avir
15. GCGGCAGCGGGGAGGAGAGGAGAGAGAAGA
us),
16. GCGGGAGAAGCCTCTGCGGTAGCGGCGGCG
TORCH ,
RV:
, 1. CTGGCCGAGACGGCCAGCGAGGCGTGGCAC
2. CACAGGCGTGCCCCCTCGGGCGAGCACGCG
[ 1]
3. ATCTACATCGATGAGGCGTTCACTCTCGGC
TORCH 4. AGCGGCCCCCCCACGTCAACCAGGGCAGAC
,
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