基于分子互作网络的MMPs相关基因在胃癌组织中的表达研究.pdfVIP

一 56 一 ChinJLabDiagn，January，2015，Vol19，No．1 文章编号 ：1007—4287(2015)01—0056—04 基于分子互作网络的MMPs相关基因 在 胃癌组织中的表达研究 许建婷 ，金浩范 ，王冀邯 ，牛 超。，高长璺 ，王国庆 ，李 凡 (1．吉林大学基础医学院，吉林 长春 130021；2．吉林大学第一医院 肿瘤中心，吉林 长春 130021) 摘要：目的 探讨 MMPs相关分子互作网络在 胃癌组织中的表达情况。方法 运用 1O对 胃癌及相应癌旁组织 芯片筛选 胃癌组织 中差异表达基 因，结合 BioGRID数据库 ，构建 胃癌组织 中表达异常的MMPs相关分子互作 网络。 结果 胃癌 中多个 MMPs家族成员及其互作 网络 中的 18个基 因均呈高表达状态 ，主要参与的生物学过程及通路和 癌症细胞的侵袭、转移等过程密切相关 。结论 高通量组学及相关数据库、分析工具的结合有助于构建癌症 中表达 异常的分子互作网络，为后续的研究提供较全面的分子学机制基础。 关键词 ：分子互作 网络 ；MMPs；BioGRID数据库 ；GO；Pathway 中图分类号 ：R735．2 文献标识码 ：A Expression analysisofMM Psandtheirrelatedgenesbasedonthemolecularinteractionnetworkingastriccancertissues XUJian—ting，JINHao一，n ，W_ANGJi—han，eta1．(CollegeofBasicMedicalSciences，JilinUniversity，Changchun 130021，China) Abstract：Objective ToexploretheexpressionofMMPs—relatedmolecularinteractionnetworkingastriccancer tissues．M ethods 10pairsofgastriccancerandtheircorrespondingpara-carcinomatissueswereanalyzedwithmicroar— rayforscreeningofthedifferentiallyexpressedgenes，thenconstructedthedifferentiallyexpressedMMPs—relatedmo— lecularinteractionnetwork ingastriccancertissuesbyintegratingtheinformationfrom BioGRID databasesandthemi— croarrayresults．Results 18genesintheMMPs—relatedmolecularinteractionnetwork (alsoincludingseveralMMPs members)wereup-regulatedingastriccancertissues，themainbiologicalprocessesandpathwaysthattheyparticipated inwerecloselyrelatedwithcancerinvasionandmetastasisprogression．Conclusion Thecombinationofhigh-through— putgenomics，bioinformaticdatabasesandanalyticaltoolsisnecessaryfortheanalysisofcancer-relatedmolecularinter— actionnetwork，whichwillprovidemorecomprehensivemolecularmechanismsforthefutureresearch． Keywords：molecularinteractionnetwork；MMPs；BioGRID ；G0；Pathway