脉冲场凝胶电泳技术_PFGE_在分子分型中的应用现状.pdfVIP

· · 276 疾病监测 年 月 日第 卷第 期 , , , 20065 31 21 5 DiseaseSurveillanceMay.31,2006Vol.21No.5 ·综 述· 脉冲场凝胶电泳技术（PFGE）在分子分型中的应用现状 王丽丽, 徐建国 关键词 脉冲场凝胶电泳;分子分型;应用 : 【中图分类号】R-331 【文献标识码】B 【文章编号】1003-9961（2006）05-0276-04 近年来,以脉冲场凝胶电泳( 统计学上就可以应用了。对于那些评估多种特性 Pulsedfieldgel , )为代表的分子生物学分型方 的技术来说,如噬菌体分型和电泳分型技术,当可 electrophoresisPFGE 法日渐受到青睐,其原理为通过一定的方法,直接 重复性降低时,分辨力通常下降。这是因为要可靠 或间接反映病原体变异分化的本质即 序列 地进行区分,不相关的菌株必须在许多特性方面 DNA 的改变,从而做到微观变化的宏观显示。电泳结果 不同。 通常是条带图谱。该方法的发展成熟为监测控制 4 流行病学相关性 ( ) 细菌的流行提供了广阔的前景。通过分型可以鉴 指分子分型的结果与流行病学资料相符,易于解 定比较菌株是否一致,对于细菌性传染病监测 释,得到的结果逻辑性强、客观,解释更加可靠。 , [12] 、传染源追踪、传播途径调查和识别等暴发调 5 可比性( ) 指不同操 , [34] 查有着非常重要的意义 。 作人员,尤其不同实验室之间分型结果的可比性。 参考 EuropeanStudyGrouponEpidemiological6 灵敏性 是指所选的分型方法能尽可能反映 指出的评价流行病学分型系统 较多的变化(差异)信息,反映有意义的变异信息。 Markers (ESGEM) 时要考虑的几个标准,对于分子流行病学分型方 7 分型方法 快速、费用低、技术简单、易于操作。 法的选择,我们认为应该以下列标准来衡量: 目前对病原细菌常用的分子生物学分型方法 分型力 ( ) 指对被分析的每一菌株 有:限制性片段长度多态性 ( ),特定片段 1 typeablity RFLP 能够获得明确的、不似是而非的、阳性结果的能 ,随机扩增多态性 片段( ),基因外 PCR DNA RAPD 力。不可分型菌株是指那些没有结果或者结果不 重复回文序列 ( ),裂解酶片段长度 PCRRep-PCR 可解释的菌株。 多态性 ( ),扩增片段长度多态性 ( ),