华支睾吸虫ATP合酶B亚基全长基因的生物信息学分析.pdfVIP

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华支睾吸虫ATP合酶B亚基全长基因的生物信息学分析.pdf

垫堂医堂盘查2堂生垒旦箜!鲞箜垒塑 ·315· 【文章编号J 1672.3619(2007)O伽315-04 ·基础研究论著· 华支睾吸虫ATP合酶B亚基全长基因的生物信息学分析 周红娟,余新炳,徐劲,胡旭初木 (中山大学中山医学院寄生虫学教研室,广州510080) 【摘要】 目的从华支睾吸虫全长cDNA质粒文库中识别A7rP合酶B亚基,利用生物信息学方法预测其 结构和功能特征.用以指导实验研究。方法利用生物信息学网站的各种在线分析工具和VectorN,11辄沁软件 包,识别华支睾吸虫A佃合酶B亚基基因并预测编码蛋白质的各种结构与功能特征,并根据该基因构建种系 分子进化树。结果Bl羽投分析该基因为全长基因,属于ATP合酶B亚基家族,其分子进化树与种系进化过程 008 非常吻合。该基因全长1 bp,编码300个氨基酸,含有线粒体转运肽、两个跨膜区、一个核定位序列和多个 磷酸化位点.具有较稳定的理化性质。结论A1P合酶B亚基是一个理想的真核种系进化的分子标志。华支睾 吸虫A7腰合酶B亚基具有线粒体和细胞核的双重定位序列,提示该蛋白可能在华支睾吸虫的能量代谢途径中 发挥独特的调节作用。 【关键词】华支睾吸虫;A皿合酶B亚单位;生物信息学 中图分类号:R383.22文献标识码:A the C铂肋Ⅳ愚括s切口儿豳 BioiI怕maticsof AnalysisFllll-Length Gene ATP BChain—Like Synth嬲e ZHOU Xu—chu+ Jin,HU Hong-juan,YUXjn-bing,XU (脚硎脚眦矿%麟删9吕y,Z硒咿危帆肌舭以cDzfe酽矿Suny越删n咖眈瑙毋, G呦移加“5JDD8D,傩妊) 0f Bchain To thestrIlctu∞明d缸nctionsc幻加rc^括s妇瑚蠡A11P Objective 8ynthase by 【Abs咖毗】 predict 0f cDNAobtained舶mthecDNA A tIle伽kngth libmry.MethodfIlll-length 蛐alyzingtlle驰qllence plasnlid w鹏iden雠ed舶m cDNA 蛐dtlle 腑一synth黯eB一1ikegene me∞∞rc觚5沁瑚缸伽一lengthplasmid1ibmry, stmctuTe柚d如nctionswere thewebbasedbioiIlfbmIaticstool8andtIIe by analyzing con.esponding pmdicted

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