巴西橡胶树磷脂酰肌醇转移蛋白cDNA的克隆及其序列分析.pdfVIP

基因组学与应用生物学，2010年，第 29卷，第 1期，第 164—169页 GenomicsandAppliedBiology，2010，go1．29，No．1，164—169 数据分析 AnAnalysis 巴西橡胶树磷脂酰肌醇转移蛋白eDNA的克隆及其序列分析 罗明武 邓柳红 1海南大学材料与化工学院，海 口，570228；2中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海 口，5711O1 通讯作者，dengliuhong168@163．com 摘 要 本文从巴西橡胶树Heveabrasiliensis)差减 eDNA文库中筛选到一个与磷脂酰肌醇转移蛋(~(phos． phatidylinositoltransferprotein)同源性较高的基因片段，并根据该基因片段序列信息，设计特异性引物，采用 eDNA末端快速扩增技术 RACE(rapidamplificationofeDNAends)进行差异片段的5’和 3’端的扩增，并获 得长度为 1081bp的全长eDNA克隆R291(GenBank登陆号：AY589690)。序列分析表明，该基因包含702bp 的开放阅读框 ，编码 234个氨基酸，推测其蛋 白质的分子量为 26．8kD，等 电点为6．51，有一个的跨膜螺旋 区(氨基酸位点为 83-103)。R291基因含有一个脂质结合保守区(Secl4p．1ikelipid—bindingdomain)，具有 CRAL—TRIO脂质结合结构域，推测该基因是一个磷脂酰肌醇转移蛋 白基因。该基因的克隆将为橡胶树磷脂 酰肌醇代谢的研究奠定了基础，将有助于进一步了解磷脂酰肌醇代谢与胶乳再生之间的关系。 关键词 巴西橡胶树，胶乳，磷脂酰肌醇转移蛋白，AR CE，序列分析 CloningandSequenceAnalysisofPhosphatidylinositolTransferProteincD— NAfrom Heyeabrasilensis LuoM ingwu DengLiuhong lCollegeofMaterialsScienceandChemicalEngineering，HainanUniversity，Haikou，570228；2InstituteofTropicalBioscienceandBiotechnology ChineseAcademyofTropicalAgriculutralSciences，Haikou，571101 Correspondingauthor，dengliuhong168@163．com DOI：10．3969／gab．029．000164 Abstract Inthispaper，aeDNA clonewasisolatedrelatedtolipidtransportationandmetabolism byscreening ofa subtracted latex eDNA library ofHevea brasiliensis．According to itssequencesinformation，anovel full—lengtheDNAtermedR291(GenBanknumber：AY589690)wasobtainedbyusingrapidamplificationofeDNA ends(RACE)．R291was1081bplongcontaininga702bpORF，encoding234aminoacidswithatheoreticalmolecu larweightof26．8kDandanisoelectricpointof6．51．nI addition,hydropathyandtransmembranemotifanalysisofde— ducedaminoacidsequencesindicatedthatR291possessedatransmembranespanningdomain(fromtheaminoacid siterfom 83to103)．TheresultoftheconserveddomainsanalysisdemonstratedthatR291hadaSecl4p—like lipid—bindingdomainandaCAR L／TRIO region．MultialignmentpresumedthatR291mightbeaphosphatidylinos— itoltransferproteingene．Thecloningofthisgenewouldestablishth