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DNA dependent DNA polymerase——DDDP DNA dependent RNA polymerase——DDRP RNA dependent RNA polymerase——RDRP RNA dependent DNA polymerase——RDDP 3 生物信息的传递(上)——从DNA 到RNA 3.1 RNA转录合成的特点 3.2 原核生物RNA的转录过程 3.3 真核生物RNA的转录过程 3.4 原核生物RNA的转录后加工 3.5 真核生物RNA的转录后加工 3.1 RNA转录合成的特点 ◆定义:在RNA聚合酶的催化下,以一段DNA链为模板合成RNA,从而将DNA所携带的遗传信息传递给RNA的过程称为转录。 ◆以双链DNA中的一条链上的一段DNA作为模板进行转录,从而将遗传信息由DNA传递给RNA; ◆对于一个基因组来说,转录只发生在一部分基因,而每个基因的转录都受到相对独立的控制。 ◆对于不同的基因来说,其转录信息可以存在于两条不同的DNA链上。与RNA序列完全相同的那条DNA链称为有意义链(编码链),而与mRNA互补的另一条DNA链称为反意义链(模板链)。 ◆RNA转录合成时,以DNA作为模板,在RNA聚合酶的催化下,连续合成一段RNA链,各条RNA链之间无需再进行连接。 ◆合成的RNA中,如只含一个基因的遗传信息,称为单顺反子;如含有几个基因的遗传信息,则称为多顺反子。 ◆RNA转录合成时,只能以DNA分子中的某一段作为模板,故存在特定的起始位点和特定的终止位点,特定起始点和特定终止点之间的DNA链构成一个转录单位,通常由转录区和有关的调节顺序构成。 ◆转录起点:指与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基。 ◆上游(Upstream):转录起点前面即编码链5’末端的序列 ◆下游(Downstream):转录起点后面即编码链3’末端的序列 RNA合成不同于DNA合成之处 转录是不对称的 转录是连续的且不需要引物 转录是单向性的 转录后DNA模板成分无改变 RNA合成过程中无较对作用 ◆以DNA为模板 ◆都以四种三磷酸核苷(A、U、G、C)为底物 ◆都遵循DNA与RNA之间的碱基配对原则 ◆ RNA链的延长方向是5’→3’的连续合成 ◆需要Mg2+或Mn2+离子激活 ◆能催化两个游离的NTPs之间形成磷酸二酯键(不需要引物) ◆RNA聚合酶没有核酸酶的活性,在RNA合成过程中不起较对作用。 RNA聚合酶催化的反应 ◆全 酶:α2ββ’σω ,465kD,与RNA链的起始有关 ◆核心酶:α2ββ’ω ,与RNA链的延长有关 ◆按其对α-鹅膏蕈碱敏感性而分为三种: 酵母RNA聚合酶Ⅰ和Ⅱ 启动子序列的识别 RNA转录的起始 RNA链的延伸 转录的终止 ◆启动子(promoter) 位于基因上游,与RNA聚合酶识别,结合并起始转录有关的一些DNA序列(双链)。 ◆原核生物启动子的特点: (1)DNA序列在转录起始点的5’端区(上游区) (2)-10区:TATAAT(pribnow box),牢固结合位点,解链区 (3)-35区:TTGACA(sextama box),σ因子识别位点 (4)相距16-19bp:为聚合酶提供合适的空间结构 ◆CAP位点(Catabolite Activator Protein binding site) CRP位点(cAMP receptor protein binding site ) 在启动子上游,可与CAP蛋白结合,促进RNA聚合酶与启动子区结合或诱导解链;具有反向重复序列。 ◆识别过程 全酶与DNA分子随机结合,形成松弛复合物 σ因子在DNA双链寻找启动子 σ因子识别转录起始点(-35区),促使形成 封闭复合物,并滑动到-10区 二、RNA转录的起始 ◆ RNA聚合酶全酶促使局部双链解开 ◆ “关闭”复合体转变为“开放”复合体 ◆并催化ATP或GTP与另外一个三磷酸核苷聚合,形成第一个3,5-磷酸二酯键。 三、 RNA延长 σ因子从全酶上脱离; DNA的解链和重复螺旋化; 余下的核心酶继续沿DNA链移动,连续聚合RNA。 四、终止 ◆终止子:DNA转录的终止信号序列(terminator) ◆不依赖ρ因子的终止子:内在终止子(intrinsic terminator ) 有双重对称DNA序列(dyad),富含GC,可形成茎环结构;其后DNA模板链中有一串约6个A,转录为RNA3’端的U。 大肠杆菌两类终止子的回文结构 ◆ RNA聚合酶II识别的启动子(mRNA和SnRNA) DNA序列在转录起始点的5’端区(上游区) -25~-35bp:TA
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