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锦鲤保护性组织RNA提取及引物扩增研究.pdf
锦鲤保护性组织 RNA 提取及引物扩增研究
﹡
王亚军,吴立山,洪松柏,刘必谦
宁波大学“应用海洋生物技术”教育部重点实验室-海洋生物工程省重点实验室,浙江宁波
(315211)
E-mail :wangyajun@
摘 要:品质优良的锦鲤个体十分珍贵,分子生物学研究中,在不杀死、不伤害锦鲤个体的
情况下,获取完整的组织细胞RNA,十分关键。对锦鲤。取鱼体的鳍条、鳞片、鳃丝、血液,
利用 TRizol 法提取 RNA。结果表明,从以上各种组织提取到的 RNA 质量高,特异性引物扩
增效果好,可以满足进一步分子生物学研究的需要。
关键词:锦鲤;保护性组织; RNA提取;引物扩增
1.引言
锦鲤是淡水养殖观赏鱼中的精品,被称为水中宝石,经过长期的人工选育,已经形成了
众多花色、品系,每年国内外都举行多种比赛,体色、体形具佳的个体价格昂贵。随着观赏、
养殖的不断发展,国内外锦鲤研究项目呈不断上升趋势。在锦鲤体形、体色及生长等方面的
研究中,基于分子生物学的研究必须用到 DNA ,RNA 样品[1],相关报道中养殖个体的取样
以鱼体的肌肉、肝脏、脑等组织为主,这些组织的取样或要杀死个体,或会对养殖锦鲤造成
致命性的伤害,极易造成个体感染死亡[2,3] 。对于价格昂贵的珍稀个体,就无法用作取样对
象,但这些个体往往又是研究的极佳材料。如何获得各方面都能满足实验要求的RNA 样品,
又尽量少伤害被取样个体,使其不发生致死或感染,成为高品质锦鲤个体分子生物学研究的
出发点。本研究重点研究了用鳍条、鳞片、腮丝、血液等四种组织提取RNA,并且利用获得
的RNA 进行逆转录反应及相关基因的引物扩增。
RNA 提取最大的困难是 RNA 容易降解,外源性和内源性的 RNA 酶污染很难控制,在
整个提取分离的过程中有很多方法可以运用,常用的如异硫氰酸胍/氯化铯法、硫氰酸胍/
热酚法、氯化胍法、氯化锂/异硫氰酸胍法,以及现在使用较多的 TRizol 法,各种方法都有
一定的特点、优势。本研究以锦鲤鳍条、鳞片、腮丝、血液为材料,采用 TRizol 法提取 RNA,
得到了较高质量的 RNA ,并用相关基因的引物进行了 RT-PCR 扩增,得到了较为满意的结
果。取样个体的活力、健康性不受影响。
2. 材料与方法
2.1 材料
实验用锦鲤取自宁波大学海洋生物工程重点实验室养殖基地,为红白双色个体,体长
40cm ,体重2.5kg。用撒网从池中捕出,尾静脉取血,其余组织样品经过 PBS 清洗放入1.5ml
离心管中,液氮冻存运输回实验室,-80℃超低温冰箱冻存。
2.2 实验器皿的处理
玻璃器皿、剪刀、镊子等清洗干净后在 200℃烘烤 8h。离心管,移液枪头用 0.1%的DEPC
(焦碳酸二乙酯)溶液浸泡过夜,并在 121℃高压灭菌 30min 以除去DEPC,100 ℃烘干备用。
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2.3 试剂
①磷酸盐缓冲溶液( PBS) : 1.15 g 磷酸氢二钠, 012 g 磷酸二氢钾, 8 g 氯化钠,012 g 氯化钾,
pH 7;②TRizol (invitrogen 产品)、氯仿、异丙醇、75%乙醇、DEPC 处理水③M-MLV 逆转
录酶、Oligo dT18 反转录扩增体系④β-actin 引物,热激蛋白 hsp90 引物,PCR 扩增体系⑤
琼脂糖、10×凝胶加样缓冲液。以上溶液均用 0.1%DEPC 水配置,灭菌处理。
2.4 方法
①取样:1.血液:取 2ul 血细胞 2. 用处理过的剪刀、镊子取鳃、鳍、鳞 30mg 左右组织,
迅速将各组织剪碎。
②在 1.5ml 离心管中加入 300ul TRizol,加入各组织,
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