最大匹配问题tile自组装模型【精选】.pdfVIP

第 42卷 第 2期 湖 南 大 学 学 报 (自然 科 学 版 ) Vo1．42，No．2 2 O 1 S 年 2 月 JournalofHunanUniversity(NaturalSciences) Feb．20 15 文章编号 ：1674—2974(2015)O2一Ol14一O7 最 大 匹 配 问 题 Tile 自组 装 模 型 周 旭 ，周炎涛 ，李肯立 ，潘 果 (1．湖南大学 信息科学与工程学院，湖南 长沙 410082；2．嘉兴学院 数理与信息工程学院，浙江 嘉兴 314001； 3．湖南大学 电气与信息工程学院，湖南 长沙 410082) 摘 要：Tile自组装模型凭借其 自组装 、可编程等特性在解决 NP 问题方面具有 巨大优 势．文中提 出了一种求解最大匹配问题 的Tile自组装新模 型，该模 型主要 由初始配置子系 统、选择子 系统及检测子 系统 3大部分构成．新模 型中首先设计 Tile分子存储 问题信息，其 次通过 Tile分子 自组装操作生成最大匹配问题解空问，最后通过 Tile检测分子筛选得到最 大匹配问题的解．对模型从所需 Tile分子种类、计算时 间和计算空 间3个方面进行性 能分 析 ，并通过实验模拟论证 了模型的有效性和正确性． 关键词 ：DNA计算 ；Tile自组装模型；最大匹配问题 ；NP完全问题 ；并行计算 中图分类号：TP301．6 文献标识码 ：A EfficientTileAssemblyModelforM aximum MatchingProblem ZH ()U Xu一，ZHOU Yan—tao-计，LIKen—li。PAN Guo (1．SchoolofInformationScienceandEngineering，HunanUniv。Changsha，Hunan 410082。China； 2．CollegeofMathematicsandInformationEngineering，Jiaxinguniv，Jiaxing。Zhejiang 314001，China； 3．CollegeofElectricalandInformationEngineering，HunanUniv，Changsha。Hunan，410082，China) Abstract：Thecharacteristicsoftileself—assemblymodelarenanoscaleproperties，self—assembly，pro— grammableandSOon，soithasagreatadvantageinsolvingNP problems．Thispaperproposedanew tile self—assemblymodelformaximum matchingproblem．Thenew modeliscomposedofinitialconfiguration subsystem ，choosingsubsystem and detectingsubsystem．In thenew modelDNA tilesweredesignedto storetheinformation．Thesolution spaceofmaximum matchingproblem wasgenerated through theas— semblyoperation．Lastly，theanswerswerefoundoutbythedetectingtiles．Theperformanceofthealgo— rithm wasalsoanalyzedintermsoftheassemblytime，thecomputationspaceandthetypesofthetiles， andthealgorithm wassimulatedtoproveitseffectivenessandcor