基于本体和SWRL规则分析健康体检结果的研究.pdfVIP

基于本体和SWRL 规则分析健康体检结果的研究 ① ① 胡占生 李小华 基金项目：国家高技术研究发展计划（编号：2012AA02A611） ①广州军区广州总医院 信息科，广东 广州 510010 摘 要 提出了一种基于本体和SWRL 规则运用本体推理技术实现了从健康体检结果中智能 化分析体检异常的方法，并设计了一套软件系统实现了这种方法。对比50 份分别由体检医 生和本系统分析得到的结论，评价了系统的有效性和准确性。 关键词 本体 SWRL JESS 体检 1 引言 在体检过程中，总检医生的一项重要工作就是对参检人的已有的化验结果、仪器检查结 果和分检医生诊查结果等进行分析，得出参检人有哪些方面的健康风险。这种分析的过程通 常是采用一些固定的逻辑，例如“总胆固醇超过5.72mmol/L，甘油三酯超过1.70mmol/L， 诊断为高脂血症”。相对于一般的医学诊断而言，总检医生需要做的分析工作比较简单和固 定，但总检医生每天诊断的人数更多，工作量较大，容易出现差错。用计算机来辅助总检医 生分析体检结果可以减轻医生的工作负担，也可以为人工分析结果查漏补缺。目前常见的是 基于关键词的辅助分析方法，这种方法实现较为简单，但智能化程度不高，通用性不强。本 文设计了一种基于本体和SWRL 规则的推理方法，运用这种方法实现了一个原型系统，并通 过实验验证了系统的有效性，分析了系统的优缺点。 2 方法 [1] 2.1 推理方法概述 本体推理的原理是描述逻辑 ，描述逻辑作为一种知识表示方法，它不 但可以表示领域中的知识，也具有推理机制，能够推导出隐含的知识。在描述逻辑中的推理 分成概念推理和实例检测两种，本文中的推理属于实例检测，也就是判定一个给定的个体是 否是一个给定概念的实例。例如，某参检人总胆固醇为6.1mmol/L，判定他是否是“高脂血 症”这个概念的实例。 本文中采用Jess 推理引擎，其基本结构如下图所示。应用推理引擎首先需要构造体检 信息本体和编写SWRL 推理规则。 图2-1 Jess 推理引擎结构 2.1.1 构造体检信息本体 体检信息的知识领域范围比较狭窄，从文献检索和从本体搜索引 擎swoogle 中查找相关的本体，都没有找到合用的。本文中新建了一个体检信息领域本体， [2] 建立本体的方法采用了Natalya F.Noy 等提出的Ontology Development （七步法） 。 体检信息领域本体的建立过程参考了原体检信息系统数据库的元数据。体检信息系统 已经对体检领域中的重要概念进行了总结。数据库的“字典表”常常可以对应本体中的“属 性”，例如每个“体检项目”都可以看做是一个属性；而对于数据库的“数据表”来说，表 列通常可以对应本体中的“类型”或者“属性”，表行可以对应本体中的“实例”，例如参检 人的概念可以对应本体中的“对象”，性别、年龄可对应参检人的“属性”，具体的某个参检 人可对应本体的“实例”。 图2-2 体检信息本体的局部图 ．荔爹。篡鬟饕≤茏： 2.1.2 建立推理规则 以“乙肝患者”这种体检异常为例，一般来说，体检结果中：乙肝表 面抗原阳性，乙肝e 抗原阳性，乙肝核心抗体阳性，同时谷丙酶40 的可以判断为乙肝患者 [3] 。把以上的自然语言翻译为SWRL 的Atoms，转化为SWRL 的规则如下： 学“峪一。、吣：…。 。·键品 2.2 分析系统实现 要应用上面建立的本体推理引擎，还需要解决以下两个问题：1.体检信 息本体和SWRL 规则的读取和更新，包括实例写入，分析结果查询等；2.与体检信息系统的