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LncRNA-UCA1 与淮安食管癌发病风险的初步研究
李夏君 杨淼 刘冉 尹立红 浦跃朴6
(东南大学公共卫生学院环境医学工程教育部重点实验室,江苏,南京,210009)
摘要:目的 初步筛选淮安食管鳞癌与癌旁组织中差异表达的 LncRNAs,为进一步研究与肿瘤相关
的lncRNAs 在食管鳞癌发病机制中的作用奠定基础。方法 分别提取 3 例患者食管癌组织及配对癌
旁组织的总 RNA ,体外逆转录制备并标记为双链 cDNA(ds-cDNA),与人类LncRNA 表达谱芯片进
行杂交,经扫描后,用 Agilent GeneSpring GX v11.5.1 软件进行分析运算,筛选出差异表达的
LncRNAs 。qRT-PCR 分析 LncRNA 在食管癌细胞及组织中表达情况。结果 按照 Fold Change ≥2.0,
P-value ≤0.05 的标准,筛选出表达差异有统计学意义的LncRNAs 共 1019 个,其中 399 个上调, 620
个下调。GO 分析和 Pathway 分析结果显示这些 LncRNAs 调控的差异表达的 mRNAs 主要与细胞周
期、细胞分化、蛋白酶的活动等有关。结合 Gibb 食管癌相关的 LncRNA 差异表达谱分析发现
lncRNA-UCA1 可能参与食管癌发生发展。 QRT-PCR 结果显示,与永生化食管上皮细胞及癌旁组织
相比,食管癌细胞及食管癌组织中 lncRNA-UCA1 均表达下调。 结论 本次研究共筛选出 1019 个具
有统计学意义的差异表达 LncRNAs,其中LncRNAs-UCA1 可能成为食管癌早期发现和诊断的生物
标志物。
关键词:食管癌;lncRNA-UCA1 ;荧光定量RT-PCR
Association between LncRNA-UCA1 expression deregulation in esophageal carcinoma and the r
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