外周全血中与老化相关的DNA甲基化标记的来源.pdfVIP

篷 Hereditas(Beijing)2015年2,el，37(2)：165--173 WWW．chinagene．cn 研究报告 外周全血中与老化相关的DNA 甲基化标记的来源 李红东 ，洪贵妮 ，郭政 ，2 1．电子科技大学生命科学与技术学院，成都 610054； 2．福建医科大学基础医学院，消化道恶性肿瘤教育部重点实验室，福州 350108 摘要：机体老化与癌症、神经退行性疾病等许多复杂疾病相关。目前，研究者已在外周全血中识别 了大量的与 老化相关的DNA 甲基化标记，这些标记可能反映外周血白细胞在机体老化过程 中发生的变化，也可能反映外 周血中与年龄相关的细胞构成比例的变化。文章利用 3组正常个体外周全血 DNA 甲基化谱，采用 Spearman 秩相关分析识别 了与老化相关的CpG甲基化位点(age-relatedDNAmethylationCpGsites，arCpGs)并评价 了其可 重复性；利用去卷积算法估计了各外周血样本中髓性和淋巴性细胞的比例并分析了其与年龄的相关性；比较了 在外周全血、CD4+T细胞和CD14+单核细胞中识别的arCpGs的一致性。结果显示，在独立外周全血数据中识 别的arCpGs具有显著的可重复性(超几何检验，P=I．65x10 ) 外周血髓性和淋巴性细胞的比例分别与年龄显 著正、负相关(Speamran秩相关检验，PO．05，r≤0．22)，它们间DNA 甲基化水平差异较大的CpG位点倾向于 在外周全血中被识别为 arCpGs。在 CD4+T细胞中识别的arCpGs与在外周全血中识别的arCpGs显著交叠(超 几何检验，P=6．14x10 )，且 99．1％的交叠位点在 CD4+T细胞及外周全血中的DNA 甲基化水平与年龄的正、 负相关性一致。尽管在 CD14+单核细胞中识别的arCpGs与在外周全血中识别的arCpGs并不显著交叠，但是 在交叠的51个 arCpGs中，有 90．1％的位点在 CD14+单核细胞、外周全血以及 CD4+T细胞中的DNA 甲基化 水平与年龄的正、负相关性一致，提示它们可能主要反映细胞间共同的改变 在外周全血 中识别的arCpGs主 要反映某些 白细胞共同或特异的DNA 甲基化改变，但是也有一部分反映外周血细胞比例构成的变化。 关键词：外周全血；老化；DNA 甲基化；CD4+T细胞；CD14+单核细胞 Age-relatedDNA methylationchangesinperipheralwholeblood HongdongLi，GuiniHong，ZhengGuo’ ，．SchoolofZfieScienceandTechnology,UniversityofElectronicScienceandTechnologyofChina，Chengdu610054,China，‘ 2．KeyLaboratoryofMinistryofEducationforGastrointestinalCance~FujianMedicalUniversity,Fuzhou350108，China Abstract：AgingisassociatedwithmanycomplexdiseasessuchascancerandneurodegeneratiVediseases．Re- cently,many age-relatedDNA methylationbiomarkersinperipheralwholebloodhavebeenidentified．Thesebio- markersmayreflectDNA methylationchangesderivedfrom changesinthenumberofaspecificleukocytecelltype duringaging．Toclarify thesourceoftheseage—related DNA methylation changes，weanalysedDNA methylation profileofperipheralwholebloodfromthreeindependentcohortsofhealthysubjectsandidentifiedage—relatedDNA 收稿 日期：2014-11-12；修回 日期：2014-11-20 基金项 目：国家 自然科学基金项 目(编号：8I372213资助