柿EST-SSR标记在柿属植物中的通用性研究.pdfVIP

第 53卷第 22期 湖 北农 业 科 学 V0I_53No．22 2014年 l1月 HubeiAgrieuhuralSciences NOV．，2014 柿EST—SSR标记在柿属植物中的通用性研究 罗 纯 一，张青林 ．罗正荣 (1．华中农业大学园艺林学学院／园艺植物生物学教育部重点实验室，武汉 430070； 2．中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 ／农业部热带果树生物学重点实验室 ．广东 湛江 524091) 摘要 ：公共数据库和柿转录组测序产生的大量 EST序列为开发新的SSR标记提供 了有效资源。我们在前 期利用这些数据开发 出 l12个 EST—SSR标记 ，此次研 究选用其 中 11个标记对柿属 (DiospyrosL．)15个 种 2(】份试材进行 了标记通用性检测 结果表明，所有引物均能扩增出产物 ．多态性 引物 比率达 100％，并 且UPGMA聚类结果可靠 ．说 明柿 EST—SSR标记在近缘种 中可以通用。上述通用性标记为柿属植物遗传 多样性研 究提供 了标记资源 关键词 ：柿属植物 (DiospyrosL．)；EST_SSR标记 ；通 用性 中图分类号 ：Q949．775．3；Q943．2 文献标识码：A 文章编号：0439—8114(2014)22—5434—04 DOI：10．140884．cnki．issn4039—8l14．2014．22．026 TransferabilityoftheEST-SSRsDevelopedfrom DiospyroskakitootherDiospyrosSpecies LUO Chun一．ZHANG Qing-lin．LUO Zheng-rong (1．CollegeofHorticulture＆ Forestry Science，HuazhongAgriculturalUniversity／KeyLaboratory ofHorticulturalPlantBiology，Wuhan 430070，China；2．South SubtropicalCropsResearch Institute，ChineseAcademyofTropicalAgricultural Sciences／KeyLaboratory of TropicalFruitBioloyg。MinistryofAgriculture，Zhanjiang524091，Guangdong，China) Abstract：The data oftranscriptomic sequencing and growing availabilityofEST (Expressed sequence tag)sequencesfrom DiospyroskakiThunb．provide potentialvaluablesourceofnew SSR (Simplesequencerepeats)markers．Onehundredand twelve EST—SSR markersweredeveloped explored in previousstudiesand eleven markerswereused to amplify 20 genotypes 0f 15 speciesofDiospyrosL．to assessthe transferability and polymorphism．The results showed thatallprimersamplified successfully with the rate ofpolymorphicprimerof100％ indicatingthatthe EST-SSR markersdeveloped from n kakicould be applied initsrela