DNA芯片技术及其在海洋生化药物研发中应用.pdfVIP

海胆和海刺猬间的共享片段有16条，这些共享片段以及每一物种扩增的特征片段对海胆的种质鉴定以及 亲源关系的确定都具有十分重要的意义。 参考文献(略) DNA芯片技术及其在海洋生化药物研发中的应用 黄熙泰，蔡小宁，刘 寅，杨晓川 (南开大学生物化学与分子生物学系，天津300071) 一、概述 · 生物芯片是指利用微点阵技术将成千上万的生物讯息密码集中到一小片固相基质上，从而使一些传 统的生物学分析手段能够在尽量小的空间范围内，以尽量快的速度完成的新兴生物技术。 生物芯片包括基因芯片(又称DNA芯片)、蛋白质芯片、微流路芯片、芯片实验室等。而其中，技术 最为成熟，发展最成功的是DNA芯片．它将大量预先设计好的寡核苷酸或eDNA基因探针在固体基质上做 成点阵，继而利用核酸的分子杂交作用检出一个复杂体系中的靶基因或同源序列。 目前DNA芯片已经被广泛的应用到药物筛选等诸多领域，对于海洋生化药物的筛选和药理药效研究 同样可以发挥重要的作用。 二、DNA芯片的工作原理 DNA芯片的制作与工作原理如下图： 芯片制作 被测试样品的处理 探针在基质上的点 靶分子的富集和标记 入或原位合成 (基因转录、 mRNA逆转录 或PCR扩增) 探针阵列与标记 靶核酸的杂交 l ◆ 激光共聚焦扫描 采集杂交信息 I ◆ 数据处理 信息分析 ·477· 持物上，产生的寡核苷酸探针阵列密度可达1．6cm2400，000个，然后与标记的样品分子进行杂交，通过 对杂交信号的检测分析获取各样品靶分子的数量和序列信息。固定的探针除了DNA，寡核苷酸，也可以 是cDNA或来自基因组的基因片段，所以基因芯片又可称为DNA芯片，DNA微阵列(DNAmicroarrays)’ cDNA芯片(cDNA chips)，寡核苷酸微阵列等(oligonucleotidemicroarray)等。 DNA芯片可以一次性对样品中的大量靶分子进行检测和分析，从而解决了传统核酸印迹杂交 (Southern blotting和Northernblotting等)技术操作繁杂、自动化程度低、操作序列数量少、检 测效率低等不足。而且，通过设计不同的探针阵列、使用特定的分析方法可使该技术具有多种不同的应 用价值。 三、DNA芯片的应用 DNA芯片具有广泛的应用空间，概括的说主要有以下几个方面：基因表达分析：大规模DNA测序； 基因型、基因突变和多态性分析；在肿瘤研究中的应用；在病原微生物检测中的应用；在药物研究中的 应用；在中医学领域中的应用和其它应用。这里我们着重介绍其在病原微生物检测和药物研究中的应用。 1．在病原微生物检测中的应用 DNA芯片技术的最大优点为可快速、准确地提供病原体的遗传信息。在医学微生物学中已应用于以 下几个方面：微生物基冈组及后基因组的研究，可分析基因序列，研究基因的转录表达：微生物感染的快速 诊断，可同时检测多种病原体基因：微生物变异，耐药机制的研究：微生物基因分型及分子流行病学的调查： 抗微生物感染药物的研制