水稻土细菌群落结构的RFLP分析.pdfVIP

万此 ．咚让 学擅 2009，18(5)：176—18o ActaAgriculturaeBoreali—occidentalisSinica 水稻土细菌群落结构的RFLP分析 李惠民 ，岑 剑 ，王保莉 ，曲 东。 (1．西北农林科技大学 生命科学学院，陕西杨凌 712100；2．商洛职业技术学院，陕西商洛 726000； 3．西北农林科技大学 资源环境学院 ，陕西杨凌 712100) 摘 要 ：采用直接提取土壤微生物总DNA 的方法 ，提取苗期水稻根际土和非根际土土样微生物总 DNA。用 细菌通用引物扩增 16SrDNA基 因片段 ，建立克隆文库 。用限制性 内切酶 HhaI进行 PCR—RFLP分型，分别 得到 113个和 110个酶切类型。采用多样性指数和优势细菌聚类 比对方法对试验结果进行分析统计 。结果 表明，根际水稻土细菌的种属多样性指数、丰富度指数、均匀度指数 比非根际土略高；在水稻根际土和非根际 土 中的优势细菌种群分别有 3种具有完全相同的酶切类型 ，其余间存在一定的差异 。 关键词 ：水稻土 ；细菌；群落结构 ；RFLP 中图分类号 ：S511 文献标识码 ：A 文章编号 ：1004一l389(2009)05—0176一O5 RFLP AnalysisofBacterium Community in PaddySoil LIHuimin～．CEN Jian ．WANG Baoli andQU Dong。 (1_CollegeofLifeScience，NorthwestAS-FUniversity，YanglingShaanxi 712100，China；2 ． ShangluoProfessionalTechnicalCollege， ShangluoShaanxi 726000，China；3．CollegeofResourcesandEnvironment，NorthwestAFUnversty，ganglingShaanm 712100，China) Abstract：Thispaperaimstostudythecharacterofbacterialcommunitystructureofpaddysoil．Total genomeDNA ofsoilmicroorganism wasextractedbyadirectmethodfrom therhizospherepaddysoil (G)andnon—rhizospherepaddysoil(F)．The16SrDNAsoftheextractedDNA wereamplifiedusing bacterialuniversalprimersandthensetrelevantclonelibraries．UsingPCR—RFLP basedonrestriction endonucleaseHhaI，restrictionendonucleasetypesofthesesamplesweregotas113and110after counting．Usingdiversityindexandclusteringtoanalysisthedata，which showedthatthebacterial speciesdiversityindex，richnessindex，evennessindexofrhizospherepaddy soilwasslightlyhigher than non—rhizospherepaddysoil，boththeadvantagesofsoilbacteriahadthreekindsofspeciessepa— ratelywiththesameenzymetype，othersremaineddifferent． Keywords：Paddysoil；Bacteria；Community；RFLP 1904年，德 国科学家 LorenzHiltner首次提 系分泌物的种类和数量影响着根际微生物的种类 出根际 (Rhizosphere)的概念 。将根 际定义