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运用计算机系统生物学方法预测茵陈蒿汤的分子靶标 1 1 1 1 2 刘韬 ，黄红兵 ，林子超 ，刘庆 ，朱伟 （1. 华南肿瘤学国家重点实验室，中山大学附属肿瘤医院药剂科，广州 510060；2. 广东省 中医院中药制剂实验室，广州 510006） 摘要 目的：应用计算机系统生物学方法预测茵陈蒿汤的分子靶标，并阐明 有效成分群的协同作用机制。方法：采用TCMGeneDIT数据库系统，文本挖掘 茵陈蒿、大黄、栀子各自所能影响的基因或蛋白质数据；收集茵陈蒿汤中6,7- A 17 二甲基氧香豆素、京尼平苷、红花黄色素 、大黄酸、大黄素等 种血中移行 成分，采用 Accelrys 公司 Discovery Studio 2.5 版完成分子构建，并上载至 PharmMapper BIND BioGRID DIP HPRD IntAct 服务器进行靶标预测；从 、 、 、 、 、 MINT等分子相互作用数据库中收集与预测靶标有直接相互作用的蛋白质，进行 4 8 综合分析。结果：已有的实验证实： 个蛋白质与茵陈蒿相关， 个蛋白质与大 6,7- 黄相关，没有蛋白质与栀子相关。大黄酸、大黄素、 二甲基氧香豆素、绿原 6 酸等 种化学成分不但可直接作用于实验证实的靶标，也可像异秦皮啶、槲皮素 3-O- 8 葡萄糖苷等 种化学成分一样，通过影响相关靶标而发挥间接的治疗作用。 结论：本研究结果可为茵陈蒿汤的后续研究提供有用的线索，促进茵陈蒿汤的分 子作用机制研究，本研究策略可为中药复方的系统研究提供参考。 关键词 计算机系统生物学；茵陈蒿汤；协同作用 ExploringthepotentialmoleculartargetproteinsofYinchenhao ExploringthepotentialmoleculartargetproteinsofYinchenhao EExxpplloorriinnggtthheeppootteennttiiaallmmoolleeccuullaarrttaarrggeettpprrootteeiinnssooffYYiinncchheennhhaaoo decoctionusingcomputersystemicbiology decoctionusingcomputersystemicbiology ddeeccooccttiioonnuussiinnggccoommppuutteerrssyysstteemmiiccbbiioollooggyy 1 2 LIUTao ,HUANGHong-bin,LINZichao,LIUQin,ZHUWei （1.DepartmentofChemotherapy,TumorHospitalofSunYat-senUniversity,Guangzhou 510060;2.GuangdongHospitaloftraditionalChinesemedicine,Guangzhou510106） 基金项目：国家自然科学基金课题；广东省自然科学基金课题（9151063201000050）；广东省 中医药局建设中医药强省科研课题（2010109）；广东省高校重点实验室“中医女性生殖调节与安全性研究 实验室”开放基金；广东省中医院中医药科研专项课题（2010015）资助项目 第一作者：刘韬（1973），女，硕士，副主任药师，从事肿瘤药学研究。Tel