药物设计学第七讲基于受体.pptVIP

* * * * * * * * * * * * * * * * * （三）配体分子活性的评估 对连接完整的配体分子，通过一定的方法来评价它们与靶标分子的结合活性，并且进行排序，从中选择部分评价最佳的配体分子进行下一步的结构优化或合成。 （四）配体分子的合成和活性测试 选择评价最佳的配体分子进行合成，并且测定其活性，经过几轮循环，发现新的先导化合物。 * 全新药物设计的一些重要程序 全新药物设计方法出现的时间虽然不长,但发展极为迅速, 最早的全新设计方法为GRID ，然后各种方法应运而生，现已开发出一批实用性较强的软件,其主要软件有LUDI 、Leapfrog 、SPROUT、 Builder 等，其中LUDI最为常用。 * 理想的程序和方法应该满足以下标准： （1）容易使用，最好利用图形界面，产生的结构有直观性，而且界面便于用户使用。 （2）操作快捷，最好是交互式实时操作，因而能够在短时间内探索并评价更多的设想。 （3）生产的分子结构应在化学和生物学上是合理的，有意义的，不应有不稳定或者不存在的基团，并且要能够合成。 （4）能够产生多样性的结构，即不生成一种结构类型，理想的结果是生成宽阔的配体空间，从而在化学上有挑选和优化的余地； （5）生成的先导物应对受体或酶有较高的亲和力； （6）对各种受体都有操作性，能够处理各种形状、大小和化学性质的结合部位，可以