生化蛋白质代谢BYR9-303.docVIP

蛋白质代谢 翻译以mRNA为直接模板，tRNA为氨基酸运载体，核蛋白体为装配场所，共同协调完成蛋白质生物合成的过程。也就是把mRNA的碱基排列顺序转译成多肽链中氨基酸的排列顺序。 三大进展使蛋白质合成的主要过程得到认识 ①蛋白质合成的部位－核糖体；②氨基酸被氨酰tRNA激活；③遗传密码子。 1．遗传密码 密码子是指编码一个特定氨基酸的三联体核苷酸。 编码连续氨基酸的密码子中没有标点。 起始密码子：AUG 终止密码子：UAA，UAG，UGA 阅读框和可读框 阅读框就是一个在DNA或RNA中的相邻但不重叠的三联体结构。序列中的第一个特定的密码子决定阅读框。在一条单链中有3中可能的阅读框。在50或更多的密码子中没有终止密码子的阅读框，称为可读框。 遗传密码的特性 ①连续性；②读码不重叠性；③通用性；④简并性；⑤摆动性。 简并性：每一个氨基酸可能有一个以上的密码子；（甲硫氨酸和色氨酸只有一个密码子） 摆动性：大多数密码子的第三个碱基与其反密码子的相应配对比较松，使一些tRNA能识别多个密码子 意义：密码子和反密码子相互作用平衡了准确性和速度的需要。 密码子的特性 ①无标点符号；②读码不重复；③一定的防突变功能。 碱基丢失――后续氨基酸全改变 一个碱基突变――一个氨基酸改变 密码子第三个碱基改变――氨基酸可能不变（简并性，摆动性） 阅读框移动和RNA编辑 ――――― 一些mRNA在翻译前就被编辑。 在一些病毒DNA中发现不同阅读框中的重复基因 2.蛋白质合成 蛋白质合成发生在核糖体中 核糖体是一个复杂的超分子机器。 细菌的核糖体含有65％的rRNA和35％蛋白质，两个亚基分别为30S和50S，形成的完整核糖体为70S。 细菌核糖体中的蛋白质既可以作为酶，也可以作为结构的组成部分。 tRNA在将核酸转化为蛋白质的过程中起翻译者的作用 tRNA具有特殊的结构特征，分子相对较小，它的单链可以折叠形成精确的三级结构 细胞中对应于每一个氨基酸的tRNA至少有一种；至少需要32种tRNA去识别所有的氨基酸密码子，但是有些细胞会需要32种以上的tRNA去识别所有的密码子。 tRNA在5’端有一个鸟苷酸残基，所有tRNA的3’端都具有CCA序列。在二级结构中，所有的tRNA都是通过氢键结合而形成具有4个臂的三叶草形结构；长一些的tRNA分子会形成一个额外环。在三级结构中，tRNA分子形成倒L型的空间构象。 tRNA中氨基酸臂能携带特定的氨基酸，反密码子臂包含反密码子。 蛋白质合成过程 第一步：氨基酸活化 多肽合成需要满足两个基本要求： 氨基酸的每一个羧基必须活化以促进肽键的形成 每一个新的氨基酸必须与mRNA上编码它的信息联系起来。 氨酰-tRNA合成酶使正确的氨基酸与tRNA连接，形成氨酰tRNA，反应消耗ATP，氨酰-tRNA合成酶需要Mg2＋激活。 每种氨基酸只由一个专一的氨酰-tRNA合成酶催化；形成氨酰AMP中间体。 氨酰-tRNA合成酶的校对作用 tRNA的氨酰化作用包括： 活化氨基酸以形成肽键 将氨基酸接在合适的tRNA上以保证氨基酸能被准确的放置于一个增长肽链末端。 结合到tRNA上的氨基酸的身份在核糖体不被检查，所以两者的正确连接对于蛋白质的合成的精确性十分关键。 氨酰-tRNA合成酶的校对作用： 过滤氨基酸与酶的初始接合以及它被活化为氨酰-AMP； 过滤不正确的氨酰-AMP产物与酶的另一个活化部位结合; 水解氨酰-AMP上的氨基酸与tRNA形成的错误的酯键。 第二遗传密码 一种氨酰-tRNA不仅必须对一种氨基酸具有专一性，而且必须同时对某些tRNA具有专一性。氨酰-tRNA与tRNA的相互作用称为第二遗传密码。 第二步:起始 mRNA与核糖体小亚基及起始氨酰-tRNA结合，然后结合大亚基，起始氨酰-tRNA与密码子AUG配对，需要起始因子催化和ATP供能。 问题一：甲硫氨酸如何识别起始密码AUG和中间密码AUG? 甲硫氨酸的载体是两种不同的tRNA。 在原核生物中起始的是甲基化的甲硫氨酸，tRNAfMet识别起始密码，起始氨基酸残基为N-甲酰甲硫氨酸（fMet），与tRNA形成fMet-tRNAfMet；tRNAMet识别中间的甲硫氨酸。 在真核细胞中，由胞浆核糖体合成的所有多肽都始于一个甲硫氨酸残基，但又有一个与mRNA内部AUG密码子的tRNAMet不同的专一起始tRNA. 由线粒体和叶绿体合成的多肽均始于fMet。 甲硫氨酸与tRNA结合，然后转甲酰酶转移一个甲基到蛋氨酸残基的氨端。 问题二：AUG密码子如何识别作为起始的N甲酰甲硫氨酸和内部的甲硫氨酸残基？ 起始的AUG由mRNA上的SD序列引导至起始5’AUG的正确位置。 细菌核糖体有3个结合氨酰-tRNA的部位：氨酰位（A），肽位（P）和退出位（E）。 fMet-tRNA