TaqMan荧光定量PCR检测猪流行性腹泻病毒方法的建立和初步应用.pdfVIP

TaqMan荧光定量PCR检测猪流行性腹泻病毒方法的建立和初步应用.pdf

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Animal 中国动物传染病学报2010,18(1):28—33 ChineseJournalof InfectiousDiseases ·研究论文· 建立与初步应用 刘邓12袁秀芳2,冉多良1,徐丽华2,牛登元3,王朝文3,王一成2 (1.新疆农业大学,乌鲁木齐830052;2.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,杭州310021; 3.甘肃农业大学,兰州730070) 摘要:根据GenBankq公布的猪流行性腹泻病毒Ⅳ基因序列,设计了一对特异性引物和探针,扩增长度为 186bp的片段。以克隆Ⅳ基因的质粒作为阳性标准品,建立了一种快速检测猪流行腹泻病毒含量的TaqMan 荧光定量PCR方法。该方法在108~101 的质粒DNA,以猪圆环病毒、猪乙脑病毒、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪伪狂犬病毒和猪细 小病毒为模板时,均检测不到荧光信号,而重复性实验中其变异系数均小于2%,表明此方法具有很好的 特异性和重复性。应用此方法对采集的60份临床样品进行检测,其阳性检出率为92%,而用常规RT-PCR 方法进行检测,阳性检出率仅为80%。表明荧光定量RT-PCR方法的敏感性明显高于常规PCR检测方法。 关键词:猪流行性腹泻病毒;荧光定量RT-PCR;TaqMan荧光探针 文献标识码:A 中图分类号:$858.282.659.6:Q7 DEVELOPMENTANDPRELIMINARYAPPLICATIoNoF A REAL.TlMEPCRFORDETECTloN TAOM【AN。BASED oFPoRCINEEPlDEMICDIARRHEAVIRUS LIU Li—hua2,NIU Deng-yuan3, Den91一,YUANXiu.fan92,凡ⅢDuo.1ian91,XU Ⅵ,ANGChao.wen’,WANG Yi.chen92 830052.China; fi.CollegeofVeterinaryMedicine,XinjiangAgricultural University,Urumqi 2.AnimalHusbandryand 310021,China; 3CollegeofVeterinaryMedicine,GansuAgriculturalUniversity,Lanzhou73007D,China) Abstract:A186 was the and designed toPEDV-N bpfragmentamplifiedusingspecificprimersTaqManprobe according for was in real—time PCRdetectionofPEDV depositedGenBank.Subsequently,aquantitative developed genesequence withstandard DNAfromtheclonedPEDV-N ofthe was

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