原癌基因RAS系统发育分析.pdfVIP

第 25 卷第 2 期 广东农工商职业技术学院学报 Vol. 25 No. 2 2009 年 5 月 Journal of Guangdong AIB Polytechnic College May, 2009 【应用研究】 原癌基因 RAS 的系统发育分析 1 2 2. 刘光华 ，何 淼 ，刘永生 （1．广东农工商职业技术学院 热带作物研究所，广东 广州 510507 ； 2 ．中山大学 生命科学学院，广东 广州 510275 ） 摘 要：原癌基因（proto-oncogene ）是细胞的正常基因，其编码的蛋白质参与调节正常细胞的生长与分化，在控制细 胞增殖的信号转导途径中起作用。一旦受到致癌因子的影响，其活性就会发生变化，引起细胞癌变。基于目前 GenBank 的 数据，运用相关的生物信息分析工具和分析方法，可对 Ras 原癌基因的转录本序列进行比对、筛选。该文是在此基础上选用 目前较常用的构建系统发育树方法，建出系统发育树。结果表明，构建出来的树有三个大分枝，在分类学上分别是真菌界 （Fungi ）、四足动物（Tetrapoda）、体腔动物（Coelomata）。后两者又是处于后生动物，这样就可以初步确定 Ras 原癌基因 的起源分枝。 关键字：Ras 基因；多序列比对；系统发育树 中图分类号： Q279 文献标志码： A 文章编号： 1009-931X(2009)02-0073-04 一、研究现状 年随着生物信息学的发展，与数据库不断增加与更 原癌基因广泛存在于生物界(从酵母到人)，在 新，在进化角度提供了一个更为准确的平台，研究 进化过程中，这类基因高度保守。原癌基因是存在 也可以得到一个较为准确的结果。 于正常细胞内的DNA序列，并在正常细胞的增殖、 自 20 世纪中叶，随着分子生物学的不断发展， 分化和胚胎发育过程中起重要调控作用的一类正 进化研究也进入了分子进化(molecular evolution) 常细胞基因，是细胞正常代谢所必需的。在生理状 研究水平，并建立了一套依赖于核酸、蛋白质序列 态下，它们不表达或只是有限制地表达，处于非激 信息的理论和方法。随着基因组测序计划的实施， 活状态，不具有致癌性。但原癌基因一旦受到体外 基因组的巨量信息对若干生物领域重大问题的研 致癌因子（如病毒、射线、化学致癌物）的作用， 究提供了有力的帮助，分子进化研究再次成为生命 出现超表达，活性突变或一种抑癌基因的缺失，特 科学中最引人注目的领域之一。进化研究主要通过 别是数种原癌基因的同时异常活化时，就会发生细 构建系统发育过程，这有助于通过物种间隐含的种 胞的恶变，成为癌基因[1，2]，从而导致人类肿瘤的 系关系揭示进化动力的实质。 发生。 目前，对此基因的作用机制研究已经较为清 二、材料与方法 [3] （一）材料 楚。 虽然人们认识到原癌基因在进化中是高度保 守的，从原始真核生物到人类各个物种正常细胞都 在GenBank数据库搜索出的人类的H-ras原癌 存在，但在进化角度来探究此基因的起源的研究却 基因的一个转录本 v-Ha-ras Harvey rat sarcoma viral 因基因序列资源的有限而研究相对较少。早在 1996 oncogene homolog [gi:，长1061bp。 年就有学者利用