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定量PCRv :故障排除
陈云地
8008100192,021407
chenyd@
2005年
1
内容提要
实时定量故障
SNP鉴定故障
手册下载方法
2
到哪里找线索?
扩增曲线
4
原始数据能提供大量线索
FAM
ROX
TAMRA
5
各波长的原始信号
FAM VIC TAMRA ROX
6
避免错误:牢记OBT
O: Exclude Outlying wells (wells that have failed)
Exclude any samples with atypical plots or that “creep”, i.e. that do not
exhibit bona-fide amplification (have 3 points in log phase). This may
include NTCs that creep up over the threshold at 40 cycles.
B: Set Baseline
Default is 3 to 15, but set it to cover as many cycles as possible
(typically 1-2 cycles before the reporter dye signal begins to increase).
T: Set Threshold
Set halfway point in the log part of the amplification plot. Use semi-log
scale (makes the log phase of the PCR clear). A threshold for a
particular assay can be set to the same value from run-to-run.
7
实时定量故障
没有标准曲线
9
没有标准曲线
10
没有扩增曲线
Amp Plot Component
11
原始数据只有1个循环
Spectra
只有1个循环的数据
2种原因:
1。收集数据的步骤
只有一个循环,
只收集了一个数据点
2。电脑为了节省电源
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