表达谱基因芯片筛选子宫颈癌甲基化差异基因及研究.pdfVIP

·论著· 表达谱基因芯片筛选子宫颈癌甲基化 差异基因的研究 张婷 于啸 王宁 汪姗姗 王言奎 【摘要】 目的筛选人乳头瘤病毒(HPV)阳性宫颈癌细胞系中由于HPV感染诱导沉默的特异抑癌基 因，探讨HPV感染可能导致抑癌基因发生甲基化的机制。方法 理，采用Agilent人类全基因组表达谱芯片检测Aza处理前后细胞全基因组的表达水平，采用实时荧光定量PCR (RhPCR)验证芯片结果，亚硫酸氢盐一基因组测序法(BGS)检测目的基因甲基化水平。结果①芯片结果 显示：HPV阳性和阴性细胞系共721条基因表达存在差异。②用药后表达显著上调的基因：HeLa细胞系825 条，Caski细胞系815条，c-33A细胞系1023条，HT-一3细胞系1196条。HeLa和Caski细胞系共表达上调的 基因为182条，剔除阴性细胞系共表达上调基因，筛选出阳性细胞系HPV相关表达上调基因97条，与阴性细 胞系基因表达比较，差异有统计学意义(Po．01)，最终筛选出13条差异表达基因，其中具有功能者7条。③ RT-qPCR结果：筛选基因在宫颈癌细胞系中的表达与芯片检测结果一致；HPV阳性宫颈癌细胞系中甲基化频 率明显高于阴性细胞系，支持芯片结果。结论筛选出的7条新的潜在抑癌基因可能由于HPV感染诱导发生甲 基化而沉默，为进一步探讨HPV诱导抑癌基因发生甲基化的机制提供实验基础。 【关键词】 人类乳头瘤病毒；宫颈癌；抑癌基因；甲基化；芯片 of fromcervicalcarcinomawith Screeningmethylatedgene expressiongenechip ZHANG Shan岱han，WANGYardeui． Ting，yL，Xiao，WANG Ning，WANG Medical 266003，China) LAtftliatedHospitalof CollegeofQingdaoUniversity，Qingdao Toscreerl HPv [Abstract] silenttumor whichwereinducedinfectionincervi— Objective specific suppressorgenes calcancercellslinesand themechanismsoftumor HPV explore suppressorgenemethylationleadingby the cervicalcancer and cervicalCancer and ExposedHPV-positive cells(HeLaCaski)andHPV-negative cells(()_33AHT一3) tO humanwhole wereusedtodetectthe levelsbefore 5-Aza-CAR，Agilentgenomeexpressionchips expression profiting gene andB(、S andafterthe wasusedtovalidatetheresoltsof vcere treatment．RT-qI℃R microarr