蜂猴线粒体细胞色素b基因变异特点与系统发育分析.pdfVIP

维普资讯 动 物 学 研 究 2001，Apr．22 (2)：93—98 CN 53—1040／Q ISSN0254—5853 z0010gi∞lResearch 蜂猴线粒体细胞色素b基因变异特点及系统发育分析 吕雪梅 王应祥 张亚平① (中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室 昆明 650223) 摘要：测定了蜂猴属 (1v州 b )1个蜂猴 (N．coucang)和 2个倭蜂猴 (N pygmae~)个体的线粒体 细胞色素b(cD．b)基因全序列，比较现有的懒猴科其他物种序列，丹析了核苷酸序列差异和碱基替换特点， 指猴为外群重建了系统发育树。结果表明．在所研究的个体中，2个蜂猴物种碱基组成具有哺乳动物的共同 特点，它们之间转换比 (特别是密码子第 3位)是颠换 比的6倍多，大于其他种间比较；低的Ka／Ks值 (( 01)说明懒碾科 哪一b基因的异义突变位点受到强的选择压力作用。由cYt-h基因构建的系统发育树符合懒猴科 化石记录和形态学分类观点。根据化石记录和与分化时间有一定线性关系的第 3位颠换和同义突变速率，估算 蜂猴与倭蜂猴种间、蜂猴与瘠蜂猴属问可能的分化时间分别为 300和600万年。 关键词 ：蜂猴；线粒体细胞色素b基因：进化 中国分类号：Q959848 文献标识码：A 文章编号：0254—5853(2001)02—0093—06 蜂猴(．~cticebuscoucang，slowlofts)和倭蜂猴 其中唯一由线粒体基因组编码的蛋白质 (Hatefi， (5$,cti~eboztrygmaeus，lesserslowlofts)属于灵长类原 1985) 其核苷酸序列总长为 1140个碱基对 (base 始猴亚 目(Strepsirrhine)懒猴科 (Lorisidae)蜂猴属的 pair，bp)，编码 379个氨基酸。具有以下几个特 2个物种，都是夜行性动物。其主要形态 区别在于 点：①为蛋白质编码基因，比绂粒体rDNA和非编 体型大小和毛色：蜂猴的体型较倭蜂猴大，背毛上有 码 区更易于排序；②在一定的进化尺度内不受饱和 1条明显的深色背纹。蜂猴广泛分布于东南亚，倭 效应的严重影响，所提供的系统发育信息和遗传分 蜂猴主要分布于中国云南南部、老挝、越南的安南山 化水平适于分析种问或属问差异；③与其他许多分 脉(Nowak，1991)。目前关于懒猴科的化石记录很 子系统相 比，细胞色素 b基因蛋白质产物的生化机 少，仅在 巴基斯坦 Siwalik的中新世晚期地层中发现 理更易与其基 因的进化动力学相联系 (Irwinet Nycticeboides化石 (Jacobs，1981)．可能属于 Lofisine Ⅱf．，1991)。因此，在系统发育研究中，cvt．b是一 类群，但不一定是此类群现生种的祖先。而确切的 个十分有效的标记，得到广泛地应用 (Andrew 化石记录表明Lofisines和 Gal nes于中新世 晚期 0f．，1998；Zhang ＆ Ryder，1994；Yoder el 。2 ， (约 8百万年 前)已经 发生分化 (Rasmussen＆ 1996a)。 Nekaris，1998)。至今还没有发现蜂猴和倭蜂猴 2个 基于此 ，笔者对蜂猴和倭蜂猴 cyt—h基因核苷 物种祖先的化石，其分化时间尚不清楚。核型分析、 酸序列进行了测定和分析，并与懒猴科其他 2个属 核糖体DNA和线粒体DNA—RFLP的结果虽然验证 的eyt—b基因进行比较，探讨懒猴科物种cyt—b基因 了二者的分类地位(Zhangela1．，1993；Chenela1．． 的进化规律及分化时间，现将这些结果报道如下。 1993；王文等，1996)，但是对于分化时问仅根据 1 材料与方法 RFLP数据作了粗略估计 (约2．7百万年前