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生物信息学试卷.doc
1.以下关于DNA测序的说法中不正确的是（B）
A．chain terminction sequencing（链终止测序？）
B．弗朗西斯方法（PPT1 47）
C．双脱氧核酸测定
D．Sanger方法（PPT1 10）
2.蛋白质结构分析方法包括（ABC）
A.X衍射晶体学
B,核磁共振普
C.电子显微镜
D.2D gel（双向凝胶电泳）
3.序列联配的文件格式可以是（BCD）
A.Genebank
B.Fasta
C.PHYLIP（系统发育推断软件包 书P33）
D.ALN（ClustalX的格式 书P33）
4.把序列提交到三个主要数据库可以使用的工具包括（ACD）
A. WebIn (EMBL P39)
B.LinkDB（P54）
C. BankIt (NCBI P40)
D. Sequin (ncbi P40)
5.数据检索”模式代表了下列哪些序列（BC）P94
A.AGCSTAXXGDEAPGS
B.ASHPGGAPS
C.GTLVGTAPG
D.AASTGEAPG
9.以下数据库哪一个和蛋白质家族相关联（BCD）、
A.TrEMBL P40 (已注释蛋白序列)
B.PROSITE P94
C.PRINTS P95
D.BLOCKS P95
10. 遗传分类学遗传分类学螺旋的蛋白质结构预测的最佳策略Accession numbers 用NT_XXXXXX，NM_xxxxxx，和NC_xxxxxx的形式来表示
2.PDB文件的“ATOM”行展示在字符列中而不在单词列中。 P33
3.有相同折叠或拓扑结构的蛋白质或多或少包含相同的二级结构
4.Oynamic算法（？）可以计算出两条序列之间的best alignment
5．
6.
7.
8.存在这样一些蛋白，他们的序列和结构很相似，但其功能却不同
9.
10.RMSD值越大表示两个蛋白分子的三维骨架结构越相近
名词
Sequence similarity search 序列相似性搜索 P61
Local Sequence alignment 本地序列比对
Gap penalty 空位罚分 P64
Multiple sequence alignment 多序列比对
Phylogenetic trees 系统进化树 P104
Annotation 注释 P121
简答
为什么当我们做序列比对时需要考虑结构和功能的信息？
综合题
生物学实验中，通过测序获取一条未知功能DNA片段的序列，如何采用生物信息学的方法进行进一步的分析？（提示：可以从序列分析一直到结构功能预测等多方面进行发挥，并说明所用的数据库和相应的软件）
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